Protein–RNA interactions for Protein: A8K0Z3

WASHC1, WASH complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WASHC1A8K0Z3 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
WASHC1A8K0Z3 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
WASHC1A8K0Z3 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
WASHC1A8K0Z3 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
WASHC1A8K0Z3 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
WASHC1A8K0Z3 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
WASHC1A8K0Z3 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
WASHC1A8K0Z3 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
WASHC1A8K0Z3 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
WASHC1A8K0Z3 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
WASHC1A8K0Z3 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
WASHC1A8K0Z3 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
WASHC1A8K0Z3 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
WASHC1A8K0Z3 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
WASHC1A8K0Z3 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
WASHC1A8K0Z3 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
WASHC1A8K0Z3 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
WASHC1A8K0Z3 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
WASHC1A8K0Z3 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
WASHC1A8K0Z3 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
WASHC1A8K0Z3 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
WASHC1A8K0Z3 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
WASHC1A8K0Z3 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
WASHC1A8K0Z3 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
WASHC1A8K0Z3 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
WASHC1A8K0Z3 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
WASHC1A8K0Z3 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
WASHC1A8K0Z3 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
WASHC1A8K0Z3 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
WASHC1A8K0Z3 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
WASHC1A8K0Z3 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
WASHC1A8K0Z3 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
WASHC1A8K0Z3 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
WASHC1A8K0Z3 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
WASHC1A8K0Z3 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
WASHC1A8K0Z3 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
WASHC1A8K0Z3 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
WASHC1A8K0Z3 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
WASHC1A8K0Z3 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
WASHC1A8K0Z3 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
WASHC1A8K0Z3 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
WASHC1A8K0Z3 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
WASHC1A8K0Z3 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
WASHC1A8K0Z3 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
WASHC1A8K0Z3 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
WASHC1A8K0Z3 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
WASHC1A8K0Z3 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
WASHC1A8K0Z3 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
WASHC1A8K0Z3 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
WASHC1A8K0Z3 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
WASHC1A8K0Z3 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
WASHC1A8K0Z3 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
WASHC1A8K0Z3 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
WASHC1A8K0Z3 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
WASHC1A8K0Z3 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
WASHC1A8K0Z3 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
WASHC1A8K0Z3 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
WASHC1A8K0Z3 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
WASHC1A8K0Z3 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
WASHC1A8K0Z3 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
WASHC1A8K0Z3 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
WASHC1A8K0Z3 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
WASHC1A8K0Z3 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
WASHC1A8K0Z3 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
WASHC1A8K0Z3 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
WASHC1A8K0Z3 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
WASHC1A8K0Z3 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
WASHC1A8K0Z3 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
WASHC1A8K0Z3 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
WASHC1A8K0Z3 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
WASHC1A8K0Z3 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
WASHC1A8K0Z3 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
WASHC1A8K0Z3 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
WASHC1A8K0Z3 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
WASHC1A8K0Z3 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
WASHC1A8K0Z3 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
WASHC1A8K0Z3 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
WASHC1A8K0Z3 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
WASHC1A8K0Z3 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
WASHC1A8K0Z3 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
WASHC1A8K0Z3 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
WASHC1A8K0Z3 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
WASHC1A8K0Z3 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
WASHC1A8K0Z3 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
WASHC1A8K0Z3 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
WASHC1A8K0Z3 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
WASHC1A8K0Z3 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
WASHC1A8K0Z3 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
WASHC1A8K0Z3 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
WASHC1A8K0Z3 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
WASHC1A8K0Z3 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
WASHC1A8K0Z3 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
WASHC1A8K0Z3 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
WASHC1A8K0Z3 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
WASHC1A8K0Z3 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
WASHC1A8K0Z3 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
WASHC1A8K0Z3 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
WASHC1A8K0Z3 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
WASHC1A8K0Z3 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
WASHC1A8K0Z3 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms