Protein–RNA interactions for Protein: A6NGN4

PRAMEF25, PRAME family member 25, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF25A6NGN4 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF25A6NGN4 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF25A6NGN4 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF25A6NGN4 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF25A6NGN4 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF25A6NGN4 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF25A6NGN4 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF25A6NGN4 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF25A6NGN4 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF25A6NGN4 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF25A6NGN4 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF25A6NGN4 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF25A6NGN4 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF25A6NGN4 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF25A6NGN4 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF25A6NGN4 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF25A6NGN4 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF25A6NGN4 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF25A6NGN4 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF25A6NGN4 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF25A6NGN4 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF25A6NGN4 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF25A6NGN4 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF25A6NGN4 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF25A6NGN4 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF25A6NGN4 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF25A6NGN4 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF25A6NGN4 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF25A6NGN4 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF25A6NGN4 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF25A6NGN4 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF25A6NGN4 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF25A6NGN4 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF25A6NGN4 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF25A6NGN4 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF25A6NGN4 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF25A6NGN4 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF25A6NGN4 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF25A6NGN4 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF25A6NGN4 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF25A6NGN4 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF25A6NGN4 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
PRAMEF25A6NGN4 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRAMEF25A6NGN4 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRAMEF25A6NGN4 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRAMEF25A6NGN4 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRAMEF25A6NGN4 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRAMEF25A6NGN4 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRAMEF25A6NGN4 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRAMEF25A6NGN4 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRAMEF25A6NGN4 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRAMEF25A6NGN4 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRAMEF25A6NGN4 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PRAMEF25A6NGN4 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRAMEF25A6NGN4 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRAMEF25A6NGN4 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRAMEF25A6NGN4 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRAMEF25A6NGN4 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRAMEF25A6NGN4 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRAMEF25A6NGN4 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRAMEF25A6NGN4 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRAMEF25A6NGN4 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PRAMEF25A6NGN4 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRAMEF25A6NGN4 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRAMEF25A6NGN4 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRAMEF25A6NGN4 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
PRAMEF25A6NGN4 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRAMEF25A6NGN4 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRAMEF25A6NGN4 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRAMEF25A6NGN4 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRAMEF25A6NGN4 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRAMEF25A6NGN4 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
PRAMEF25A6NGN4 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRAMEF25A6NGN4 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRAMEF25A6NGN4 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRAMEF25A6NGN4 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRAMEF25A6NGN4 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRAMEF25A6NGN4 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRAMEF25A6NGN4 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRAMEF25A6NGN4 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRAMEF25A6NGN4 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRAMEF25A6NGN4 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRAMEF25A6NGN4 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRAMEF25A6NGN4 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRAMEF25A6NGN4 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PRAMEF25A6NGN4 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRAMEF25A6NGN4 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PRAMEF25A6NGN4 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRAMEF25A6NGN4 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRAMEF25A6NGN4 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PRAMEF25A6NGN4 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRAMEF25A6NGN4 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRAMEF25A6NGN4 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRAMEF25A6NGN4 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
PRAMEF25A6NGN4 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRAMEF25A6NGN4 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRAMEF25A6NGN4 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRAMEF25A6NGN4 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRAMEF25A6NGN4 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
PRAMEF25A6NGN4 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms