Protein–RNA interactions for Protein: A6NFT4

CFAP73, Cilia- and flagella-associated protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP73A6NFT4 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 BAIAP2-219ENST00000575245 2229 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CFAP73A6NFT4 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms