Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X1

SNX9, Sorting nexin-9, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX9Q9Y5X1 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SNX9Q9Y5X1 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SNX9Q9Y5X1 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SNX9Q9Y5X1 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNX9Q9Y5X1 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNX9Q9Y5X1 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNX9Q9Y5X1 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNX9Q9Y5X1 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNX9Q9Y5X1 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNX9Q9Y5X1 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNX9Q9Y5X1 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNX9Q9Y5X1 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SNX9Q9Y5X1 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNX9Q9Y5X1 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNX9Q9Y5X1 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNX9Q9Y5X1 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNX9Q9Y5X1 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNX9Q9Y5X1 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNX9Q9Y5X1 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SNX9Q9Y5X1 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SNX9Q9Y5X1 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNX9Q9Y5X1 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SNX9Q9Y5X1 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX9Q9Y5X1 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX9Q9Y5X1 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX9Q9Y5X1 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX9Q9Y5X1 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX9Q9Y5X1 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX9Q9Y5X1 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX9Q9Y5X1 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX9Q9Y5X1 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX9Q9Y5X1 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX9Q9Y5X1 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX9Q9Y5X1 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX9Q9Y5X1 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX9Q9Y5X1 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX9Q9Y5X1 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX9Q9Y5X1 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX9Q9Y5X1 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX9Q9Y5X1 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX9Q9Y5X1 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX9Q9Y5X1 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX9Q9Y5X1 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX9Q9Y5X1 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX9Q9Y5X1 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX9Q9Y5X1 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX9Q9Y5X1 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX9Q9Y5X1 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX9Q9Y5X1 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX9Q9Y5X1 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX9Q9Y5X1 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX9Q9Y5X1 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX9Q9Y5X1 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX9Q9Y5X1 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX9Q9Y5X1 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX9Q9Y5X1 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX9Q9Y5X1 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SNX9Q9Y5X1 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX9Q9Y5X1 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX9Q9Y5X1 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX9Q9Y5X1 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX9Q9Y5X1 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX9Q9Y5X1 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX9Q9Y5X1 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX9Q9Y5X1 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX9Q9Y5X1 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX9Q9Y5X1 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX9Q9Y5X1 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX9Q9Y5X1 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX9Q9Y5X1 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX9Q9Y5X1 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX9Q9Y5X1 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX9Q9Y5X1 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX9Q9Y5X1 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX9Q9Y5X1 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX9Q9Y5X1 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX9Q9Y5X1 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX9Q9Y5X1 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX9Q9Y5X1 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX9Q9Y5X1 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX9Q9Y5X1 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SNX9Q9Y5X1 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX9Q9Y5X1 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX9Q9Y5X1 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX9Q9Y5X1 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX9Q9Y5X1 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX9Q9Y5X1 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX9Q9Y5X1 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX9Q9Y5X1 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX9Q9Y5X1 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX9Q9Y5X1 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX9Q9Y5X1 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX9Q9Y5X1 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX9Q9Y5X1 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX9Q9Y5X1 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX9Q9Y5X1 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX9Q9Y5X1 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX9Q9Y5X1 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX9Q9Y5X1 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
SNX9Q9Y5X1 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms