Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3C4

TPRKB, EKC/KEOPS complex subunit TPRKB, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRKBQ9Y3C4 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 C19orf48-201ENST00000345523 1503 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TPRKBQ9Y3C4 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms