Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

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Length 582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SHOC2Q9UQ13 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SHOC2Q9UQ13 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SHOC2Q9UQ13 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SHOC2Q9UQ13 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SHOC2Q9UQ13 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SHOC2Q9UQ13 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SHOC2Q9UQ13 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SHOC2Q9UQ13 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
SHOC2Q9UQ13 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SHOC2Q9UQ13 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SHOC2Q9UQ13 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SHOC2Q9UQ13 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SHOC2Q9UQ13 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SHOC2Q9UQ13 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
SHOC2Q9UQ13 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
SHOC2Q9UQ13 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SHOC2Q9UQ13 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SHOC2Q9UQ13 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SHOC2Q9UQ13 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SHOC2Q9UQ13 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SHOC2Q9UQ13 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SHOC2Q9UQ13 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SHOC2Q9UQ13 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SHOC2Q9UQ13 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SHOC2Q9UQ13 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SHOC2Q9UQ13 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SHOC2Q9UQ13 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SHOC2Q9UQ13 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SHOC2Q9UQ13 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
SHOC2Q9UQ13 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SHOC2Q9UQ13 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SHOC2Q9UQ13 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SHOC2Q9UQ13 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SHOC2Q9UQ13 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SHOC2Q9UQ13 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SHOC2Q9UQ13 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SHOC2Q9UQ13 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SHOC2Q9UQ13 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SHOC2Q9UQ13 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SHOC2Q9UQ13 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SHOC2Q9UQ13 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SHOC2Q9UQ13 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SHOC2Q9UQ13 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SHOC2Q9UQ13 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SHOC2Q9UQ13 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SHOC2Q9UQ13 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SHOC2Q9UQ13 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SHOC2Q9UQ13 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SHOC2Q9UQ13 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SHOC2Q9UQ13 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SHOC2Q9UQ13 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
SHOC2Q9UQ13 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SHOC2Q9UQ13 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
SHOC2Q9UQ13 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SHOC2Q9UQ13 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SHOC2Q9UQ13 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SHOC2Q9UQ13 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SHOC2Q9UQ13 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SHOC2Q9UQ13 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SHOC2Q9UQ13 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SHOC2Q9UQ13 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SHOC2Q9UQ13 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SHOC2Q9UQ13 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SHOC2Q9UQ13 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SHOC2Q9UQ13 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SHOC2Q9UQ13 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SHOC2Q9UQ13 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SHOC2Q9UQ13 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SHOC2Q9UQ13 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SHOC2Q9UQ13 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SHOC2Q9UQ13 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
SHOC2Q9UQ13 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SHOC2Q9UQ13 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SHOC2Q9UQ13 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SHOC2Q9UQ13 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SHOC2Q9UQ13 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SHOC2Q9UQ13 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SHOC2Q9UQ13 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SHOC2Q9UQ13 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SHOC2Q9UQ13 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
SHOC2Q9UQ13 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
SHOC2Q9UQ13 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SHOC2Q9UQ13 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SHOC2Q9UQ13 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SHOC2Q9UQ13 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SHOC2Q9UQ13 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SHOC2Q9UQ13 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SHOC2Q9UQ13 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SHOC2Q9UQ13 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SHOC2Q9UQ13 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SHOC2Q9UQ13 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SHOC2Q9UQ13 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SHOC2Q9UQ13 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SHOC2Q9UQ13 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SHOC2Q9UQ13 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SHOC2Q9UQ13 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SHOC2Q9UQ13 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
SHOC2Q9UQ13 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
SHOC2Q9UQ13 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
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