Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX8

SHANK2, SH3 and multiple ankyrin repeat domains protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHANK2Q9UPX8 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SHANK2Q9UPX8 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SHANK2Q9UPX8 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SHANK2Q9UPX8 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SHANK2Q9UPX8 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SHANK2Q9UPX8 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SHANK2Q9UPX8 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SHANK2Q9UPX8 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SHANK2Q9UPX8 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SHANK2Q9UPX8 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SHANK2Q9UPX8 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SHANK2Q9UPX8 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SHANK2Q9UPX8 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SHANK2Q9UPX8 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SHANK2Q9UPX8 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SHANK2Q9UPX8 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SHANK2Q9UPX8 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SHANK2Q9UPX8 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SHANK2Q9UPX8 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SHANK2Q9UPX8 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SHANK2Q9UPX8 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SHANK2Q9UPX8 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SHANK2Q9UPX8 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SHANK2Q9UPX8 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SHANK2Q9UPX8 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SHANK2Q9UPX8 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SHANK2Q9UPX8 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SHANK2Q9UPX8 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SHANK2Q9UPX8 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SHANK2Q9UPX8 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SHANK2Q9UPX8 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SHANK2Q9UPX8 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SHANK2Q9UPX8 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SHANK2Q9UPX8 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SHANK2Q9UPX8 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SHANK2Q9UPX8 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SHANK2Q9UPX8 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SHANK2Q9UPX8 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SHANK2Q9UPX8 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SHANK2Q9UPX8 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SHANK2Q9UPX8 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SHANK2Q9UPX8 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SHANK2Q9UPX8 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SHANK2Q9UPX8 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SHANK2Q9UPX8 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SHANK2Q9UPX8 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SHANK2Q9UPX8 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SHANK2Q9UPX8 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SHANK2Q9UPX8 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SHANK2Q9UPX8 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SHANK2Q9UPX8 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SHANK2Q9UPX8 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SHANK2Q9UPX8 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SHANK2Q9UPX8 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SHANK2Q9UPX8 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SHANK2Q9UPX8 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SHANK2Q9UPX8 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SHANK2Q9UPX8 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SHANK2Q9UPX8 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SHANK2Q9UPX8 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SHANK2Q9UPX8 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SHANK2Q9UPX8 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SHANK2Q9UPX8 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SHANK2Q9UPX8 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SHANK2Q9UPX8 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SHANK2Q9UPX8 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SHANK2Q9UPX8 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SHANK2Q9UPX8 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SHANK2Q9UPX8 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SHANK2Q9UPX8 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
SHANK2Q9UPX8 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SHANK2Q9UPX8 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SHANK2Q9UPX8 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SHANK2Q9UPX8 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SHANK2Q9UPX8 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SHANK2Q9UPX8 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SHANK2Q9UPX8 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SHANK2Q9UPX8 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SHANK2Q9UPX8 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SHANK2Q9UPX8 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SHANK2Q9UPX8 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SHANK2Q9UPX8 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SHANK2Q9UPX8 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SHANK2Q9UPX8 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SHANK2Q9UPX8 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SHANK2Q9UPX8 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SHANK2Q9UPX8 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SHANK2Q9UPX8 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SHANK2Q9UPX8 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SHANK2Q9UPX8 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SHANK2Q9UPX8 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SHANK2Q9UPX8 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SHANK2Q9UPX8 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SHANK2Q9UPX8 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SHANK2Q9UPX8 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SHANK2Q9UPX8 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SHANK2Q9UPX8 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SHANK2Q9UPX8 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SHANK2Q9UPX8 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SHANK2Q9UPX8 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms