Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJX2

CDC23, Cell division cycle protein 23 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC23Q9UJX2 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDC23Q9UJX2 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDC23Q9UJX2 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDC23Q9UJX2 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDC23Q9UJX2 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CDC23Q9UJX2 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDC23Q9UJX2 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDC23Q9UJX2 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDC23Q9UJX2 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDC23Q9UJX2 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDC23Q9UJX2 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDC23Q9UJX2 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDC23Q9UJX2 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDC23Q9UJX2 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDC23Q9UJX2 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CDC23Q9UJX2 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CDC23Q9UJX2 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CDC23Q9UJX2 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CDC23Q9UJX2 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CDC23Q9UJX2 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CDC23Q9UJX2 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CDC23Q9UJX2 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDC23Q9UJX2 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDC23Q9UJX2 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDC23Q9UJX2 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDC23Q9UJX2 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDC23Q9UJX2 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDC23Q9UJX2 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDC23Q9UJX2 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDC23Q9UJX2 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDC23Q9UJX2 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDC23Q9UJX2 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDC23Q9UJX2 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDC23Q9UJX2 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDC23Q9UJX2 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDC23Q9UJX2 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDC23Q9UJX2 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDC23Q9UJX2 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDC23Q9UJX2 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDC23Q9UJX2 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CDC23Q9UJX2 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDC23Q9UJX2 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDC23Q9UJX2 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDC23Q9UJX2 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CDC23Q9UJX2 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDC23Q9UJX2 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDC23Q9UJX2 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDC23Q9UJX2 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDC23Q9UJX2 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDC23Q9UJX2 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDC23Q9UJX2 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDC23Q9UJX2 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDC23Q9UJX2 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDC23Q9UJX2 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDC23Q9UJX2 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDC23Q9UJX2 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDC23Q9UJX2 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDC23Q9UJX2 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDC23Q9UJX2 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDC23Q9UJX2 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDC23Q9UJX2 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CDC23Q9UJX2 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDC23Q9UJX2 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDC23Q9UJX2 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDC23Q9UJX2 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CDC23Q9UJX2 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDC23Q9UJX2 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CDC23Q9UJX2 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CDC23Q9UJX2 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CDC23Q9UJX2 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CDC23Q9UJX2 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CDC23Q9UJX2 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDC23Q9UJX2 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
CDC23Q9UJX2 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDC23Q9UJX2 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDC23Q9UJX2 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
CDC23Q9UJX2 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CDC23Q9UJX2 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDC23Q9UJX2 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CDC23Q9UJX2 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CDC23Q9UJX2 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDC23Q9UJX2 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CDC23Q9UJX2 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CDC23Q9UJX2 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDC23Q9UJX2 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDC23Q9UJX2 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDC23Q9UJX2 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CDC23Q9UJX2 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDC23Q9UJX2 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDC23Q9UJX2 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDC23Q9UJX2 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDC23Q9UJX2 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CDC23Q9UJX2 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDC23Q9UJX2 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDC23Q9UJX2 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CDC23Q9UJX2 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CDC23Q9UJX2 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDC23Q9UJX2 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDC23Q9UJX2 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CDC23Q9UJX2 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms