Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFW8

CGGBP1, CGG triplet repeat-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 167 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CGGBP1Q9UFW8 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
CGGBP1Q9UFW8 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CGGBP1Q9UFW8 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
CGGBP1Q9UFW8 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
CGGBP1Q9UFW8 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CGGBP1Q9UFW8 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CGGBP1Q9UFW8 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CGGBP1Q9UFW8 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CGGBP1Q9UFW8 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CGGBP1Q9UFW8 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CGGBP1Q9UFW8 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CGGBP1Q9UFW8 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CGGBP1Q9UFW8 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CGGBP1Q9UFW8 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CGGBP1Q9UFW8 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CGGBP1Q9UFW8 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CGGBP1Q9UFW8 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CGGBP1Q9UFW8 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CGGBP1Q9UFW8 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CGGBP1Q9UFW8 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CGGBP1Q9UFW8 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
CGGBP1Q9UFW8 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CGGBP1Q9UFW8 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CGGBP1Q9UFW8 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CGGBP1Q9UFW8 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CGGBP1Q9UFW8 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CGGBP1Q9UFW8 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
CGGBP1Q9UFW8 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CGGBP1Q9UFW8 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CGGBP1Q9UFW8 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CGGBP1Q9UFW8 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CGGBP1Q9UFW8 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CGGBP1Q9UFW8 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CGGBP1Q9UFW8 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CGGBP1Q9UFW8 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CGGBP1Q9UFW8 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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CGGBP1Q9UFW8 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CGGBP1Q9UFW8 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CGGBP1Q9UFW8 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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CGGBP1Q9UFW8 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CGGBP1Q9UFW8 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CGGBP1Q9UFW8 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CGGBP1Q9UFW8 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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CGGBP1Q9UFW8 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CGGBP1Q9UFW8 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CGGBP1Q9UFW8 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CGGBP1Q9UFW8 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
CGGBP1Q9UFW8 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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CGGBP1Q9UFW8 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CGGBP1Q9UFW8 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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CGGBP1Q9UFW8 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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CGGBP1Q9UFW8 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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CGGBP1Q9UFW8 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
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CGGBP1Q9UFW8 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
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CGGBP1Q9UFW8 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CGGBP1Q9UFW8 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CGGBP1Q9UFW8 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CGGBP1Q9UFW8 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
CGGBP1Q9UFW8 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CGGBP1Q9UFW8 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CGGBP1Q9UFW8 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CGGBP1Q9UFW8 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CGGBP1Q9UFW8 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CGGBP1Q9UFW8 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CGGBP1Q9UFW8 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CGGBP1Q9UFW8 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CGGBP1Q9UFW8 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CGGBP1Q9UFW8 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CGGBP1Q9UFW8 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CGGBP1Q9UFW8 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CGGBP1Q9UFW8 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CGGBP1Q9UFW8 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CGGBP1Q9UFW8 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CGGBP1Q9UFW8 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CGGBP1Q9UFW8 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CGGBP1Q9UFW8 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CGGBP1Q9UFW8 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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