Protein–RNA interactions for Protein: Q9UFN0

NIPSNAP3A, Protein NipSnap homolog 3A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP3AQ9UFN0 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
NIPSNAP3AQ9UFN0 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 EIF4G1-209ENST00000414031 5569 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
NIPSNAP3AQ9UFN0 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.6 ms