Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBW8

COPS7A, COP9 signalosome complex subunit 7a, humanhuman

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Length 275 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7AQ9UBW8 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
COPS7AQ9UBW8 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
COPS7AQ9UBW8 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
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