Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP0

SPAST, Spastin, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPASTQ9UBP0 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPASTQ9UBP0 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPASTQ9UBP0 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPASTQ9UBP0 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPASTQ9UBP0 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
SPASTQ9UBP0 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPASTQ9UBP0 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPASTQ9UBP0 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPASTQ9UBP0 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPASTQ9UBP0 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPASTQ9UBP0 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
SPASTQ9UBP0 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPASTQ9UBP0 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPASTQ9UBP0 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPASTQ9UBP0 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPASTQ9UBP0 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPASTQ9UBP0 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPASTQ9UBP0 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPASTQ9UBP0 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPASTQ9UBP0 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPASTQ9UBP0 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPASTQ9UBP0 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPASTQ9UBP0 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPASTQ9UBP0 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPASTQ9UBP0 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPASTQ9UBP0 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPASTQ9UBP0 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPASTQ9UBP0 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPASTQ9UBP0 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPASTQ9UBP0 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPASTQ9UBP0 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPASTQ9UBP0 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPASTQ9UBP0 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPASTQ9UBP0 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPASTQ9UBP0 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPASTQ9UBP0 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPASTQ9UBP0 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPASTQ9UBP0 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPASTQ9UBP0 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPASTQ9UBP0 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPASTQ9UBP0 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPASTQ9UBP0 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SPASTQ9UBP0 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPASTQ9UBP0 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPASTQ9UBP0 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPASTQ9UBP0 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SPASTQ9UBP0 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPASTQ9UBP0 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPASTQ9UBP0 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPASTQ9UBP0 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPASTQ9UBP0 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPASTQ9UBP0 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPASTQ9UBP0 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPASTQ9UBP0 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPASTQ9UBP0 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPASTQ9UBP0 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPASTQ9UBP0 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPASTQ9UBP0 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPASTQ9UBP0 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPASTQ9UBP0 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPASTQ9UBP0 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPASTQ9UBP0 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPASTQ9UBP0 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPASTQ9UBP0 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPASTQ9UBP0 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPASTQ9UBP0 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPASTQ9UBP0 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPASTQ9UBP0 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPASTQ9UBP0 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPASTQ9UBP0 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPASTQ9UBP0 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPASTQ9UBP0 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPASTQ9UBP0 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPASTQ9UBP0 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPASTQ9UBP0 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPASTQ9UBP0 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPASTQ9UBP0 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SPASTQ9UBP0 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPASTQ9UBP0 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPASTQ9UBP0 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SPASTQ9UBP0 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPASTQ9UBP0 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPASTQ9UBP0 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPASTQ9UBP0 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPASTQ9UBP0 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPASTQ9UBP0 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPASTQ9UBP0 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPASTQ9UBP0 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPASTQ9UBP0 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPASTQ9UBP0 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPASTQ9UBP0 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPASTQ9UBP0 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPASTQ9UBP0 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPASTQ9UBP0 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPASTQ9UBP0 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPASTQ9UBP0 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPASTQ9UBP0 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPASTQ9UBP0 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPASTQ9UBP0 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SPASTQ9UBP0 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms