Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J2

IGSF9, Protein turtle homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9Q9P2J2 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
IGSF9Q9P2J2 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
IGSF9Q9P2J2 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
IGSF9Q9P2J2 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
IGSF9Q9P2J2 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
IGSF9Q9P2J2 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
IGSF9Q9P2J2 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
IGSF9Q9P2J2 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
IGSF9Q9P2J2 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
IGSF9Q9P2J2 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
IGSF9Q9P2J2 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
IGSF9Q9P2J2 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
IGSF9Q9P2J2 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
IGSF9Q9P2J2 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
IGSF9Q9P2J2 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
IGSF9Q9P2J2 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
IGSF9Q9P2J2 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
IGSF9Q9P2J2 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
IGSF9Q9P2J2 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
IGSF9Q9P2J2 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
IGSF9Q9P2J2 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
IGSF9Q9P2J2 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
IGSF9Q9P2J2 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
IGSF9Q9P2J2 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
IGSF9Q9P2J2 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
IGSF9Q9P2J2 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
IGSF9Q9P2J2 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
IGSF9Q9P2J2 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
IGSF9Q9P2J2 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
IGSF9Q9P2J2 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
IGSF9Q9P2J2 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
IGSF9Q9P2J2 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
IGSF9Q9P2J2 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
IGSF9Q9P2J2 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IGSF9Q9P2J2 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IGSF9Q9P2J2 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IGSF9Q9P2J2 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IGSF9Q9P2J2 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IGSF9Q9P2J2 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IGSF9Q9P2J2 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IGSF9Q9P2J2 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IGSF9Q9P2J2 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IGSF9Q9P2J2 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IGSF9Q9P2J2 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IGSF9Q9P2J2 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
IGSF9Q9P2J2 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IGSF9Q9P2J2 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IGSF9Q9P2J2 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IGSF9Q9P2J2 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IGSF9Q9P2J2 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IGSF9Q9P2J2 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IGSF9Q9P2J2 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IGSF9Q9P2J2 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
IGSF9Q9P2J2 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
IGSF9Q9P2J2 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IGSF9Q9P2J2 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IGSF9Q9P2J2 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IGSF9Q9P2J2 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IGSF9Q9P2J2 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
IGSF9Q9P2J2 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IGSF9Q9P2J2 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
IGSF9Q9P2J2 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IGSF9Q9P2J2 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IGSF9Q9P2J2 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IGSF9Q9P2J2 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IGSF9Q9P2J2 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IGSF9Q9P2J2 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IGSF9Q9P2J2 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IGSF9Q9P2J2 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
IGSF9Q9P2J2 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
IGSF9Q9P2J2 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IGSF9Q9P2J2 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IGSF9Q9P2J2 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IGSF9Q9P2J2 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
IGSF9Q9P2J2 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
IGSF9Q9P2J2 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IGSF9Q9P2J2 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IGSF9Q9P2J2 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
IGSF9Q9P2J2 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IGSF9Q9P2J2 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IGSF9Q9P2J2 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IGSF9Q9P2J2 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IGSF9Q9P2J2 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IGSF9Q9P2J2 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IGSF9Q9P2J2 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IGSF9Q9P2J2 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
IGSF9Q9P2J2 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
IGSF9Q9P2J2 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
IGSF9Q9P2J2 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IGSF9Q9P2J2 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
IGSF9Q9P2J2 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
IGSF9Q9P2J2 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
IGSF9Q9P2J2 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
IGSF9Q9P2J2 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
IGSF9Q9P2J2 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
IGSF9Q9P2J2 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IGSF9Q9P2J2 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IGSF9Q9P2J2 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IGSF9Q9P2J2 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
IGSF9Q9P2J2 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms