Protein–RNA interactions for Protein: Q9P244

LRFN1, Leucine-rich repeat and fibronectin type III domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 771 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRFN1Q9P244 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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LRFN1Q9P244 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LRFN1Q9P244 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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