Protein–RNA interactions for Protein: Q9P003

CNIH4, Protein cornichon homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH4Q9P003 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CNIH4Q9P003 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms