Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR9

NKIRAS2, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS2Q9NYR9 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NKIRAS2Q9NYR9 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms