Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYP9

MIS18A, Protein Mis18-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIS18AQ9NYP9 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MIS18AQ9NYP9 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MIS18AQ9NYP9 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MIS18AQ9NYP9 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MIS18AQ9NYP9 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MIS18AQ9NYP9 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MIS18AQ9NYP9 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MIS18AQ9NYP9 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MIS18AQ9NYP9 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MIS18AQ9NYP9 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MIS18AQ9NYP9 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
MIS18AQ9NYP9 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MIS18AQ9NYP9 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MIS18AQ9NYP9 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MIS18AQ9NYP9 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
MIS18AQ9NYP9 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MIS18AQ9NYP9 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MIS18AQ9NYP9 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
MIS18AQ9NYP9 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MIS18AQ9NYP9 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MIS18AQ9NYP9 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MIS18AQ9NYP9 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MIS18AQ9NYP9 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
MIS18AQ9NYP9 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MIS18AQ9NYP9 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
MIS18AQ9NYP9 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MIS18AQ9NYP9 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MIS18AQ9NYP9 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MIS18AQ9NYP9 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MIS18AQ9NYP9 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MIS18AQ9NYP9 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MIS18AQ9NYP9 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MIS18AQ9NYP9 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MIS18AQ9NYP9 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MIS18AQ9NYP9 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MIS18AQ9NYP9 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MIS18AQ9NYP9 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MIS18AQ9NYP9 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MIS18AQ9NYP9 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
MIS18AQ9NYP9 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MIS18AQ9NYP9 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MIS18AQ9NYP9 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MIS18AQ9NYP9 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
MIS18AQ9NYP9 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MIS18AQ9NYP9 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MIS18AQ9NYP9 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MIS18AQ9NYP9 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
MIS18AQ9NYP9 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
MIS18AQ9NYP9 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
MIS18AQ9NYP9 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
MIS18AQ9NYP9 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MIS18AQ9NYP9 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MIS18AQ9NYP9 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MIS18AQ9NYP9 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MIS18AQ9NYP9 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
MIS18AQ9NYP9 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MIS18AQ9NYP9 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MIS18AQ9NYP9 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MIS18AQ9NYP9 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MIS18AQ9NYP9 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MIS18AQ9NYP9 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MIS18AQ9NYP9 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MIS18AQ9NYP9 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MIS18AQ9NYP9 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MIS18AQ9NYP9 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MIS18AQ9NYP9 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MIS18AQ9NYP9 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
MIS18AQ9NYP9 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MIS18AQ9NYP9 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MIS18AQ9NYP9 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MIS18AQ9NYP9 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MIS18AQ9NYP9 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MIS18AQ9NYP9 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MIS18AQ9NYP9 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MIS18AQ9NYP9 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MIS18AQ9NYP9 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MIS18AQ9NYP9 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
MIS18AQ9NYP9 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
MIS18AQ9NYP9 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MIS18AQ9NYP9 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MIS18AQ9NYP9 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MIS18AQ9NYP9 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MIS18AQ9NYP9 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MIS18AQ9NYP9 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MIS18AQ9NYP9 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MIS18AQ9NYP9 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MIS18AQ9NYP9 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MIS18AQ9NYP9 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MIS18AQ9NYP9 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MIS18AQ9NYP9 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MIS18AQ9NYP9 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MIS18AQ9NYP9 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MIS18AQ9NYP9 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MIS18AQ9NYP9 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MIS18AQ9NYP9 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MIS18AQ9NYP9 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
MIS18AQ9NYP9 UBE2V2-201ENST00000517630 612 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MIS18AQ9NYP9 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
MIS18AQ9NYP9 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
MIS18AQ9NYP9 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
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