Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVI7

ATAD3A, ATPase family AAA domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3AQ9NVI7 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ATAD3AQ9NVI7 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms