Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX5

SERINC1, Serine incorporator 1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC1Q9NRX5 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SERINC1Q9NRX5 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SERINC1Q9NRX5 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SERINC1Q9NRX5 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SERINC1Q9NRX5 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SERINC1Q9NRX5 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SERINC1Q9NRX5 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SERINC1Q9NRX5 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SERINC1Q9NRX5 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SERINC1Q9NRX5 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SERINC1Q9NRX5 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SERINC1Q9NRX5 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SERINC1Q9NRX5 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SERINC1Q9NRX5 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SERINC1Q9NRX5 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SERINC1Q9NRX5 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SERINC1Q9NRX5 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SERINC1Q9NRX5 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SERINC1Q9NRX5 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SERINC1Q9NRX5 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SERINC1Q9NRX5 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SERINC1Q9NRX5 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SERINC1Q9NRX5 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SERINC1Q9NRX5 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SERINC1Q9NRX5 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SERINC1Q9NRX5 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SERINC1Q9NRX5 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SERINC1Q9NRX5 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SERINC1Q9NRX5 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SERINC1Q9NRX5 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SERINC1Q9NRX5 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SERINC1Q9NRX5 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SERINC1Q9NRX5 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SERINC1Q9NRX5 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SERINC1Q9NRX5 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SERINC1Q9NRX5 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SERINC1Q9NRX5 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SERINC1Q9NRX5 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SERINC1Q9NRX5 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SERINC1Q9NRX5 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SERINC1Q9NRX5 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SERINC1Q9NRX5 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SERINC1Q9NRX5 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SERINC1Q9NRX5 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SERINC1Q9NRX5 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SERINC1Q9NRX5 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SERINC1Q9NRX5 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SERINC1Q9NRX5 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SERINC1Q9NRX5 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SERINC1Q9NRX5 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SERINC1Q9NRX5 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SERINC1Q9NRX5 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SERINC1Q9NRX5 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SERINC1Q9NRX5 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SERINC1Q9NRX5 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SERINC1Q9NRX5 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SERINC1Q9NRX5 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SERINC1Q9NRX5 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SERINC1Q9NRX5 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SERINC1Q9NRX5 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SERINC1Q9NRX5 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SERINC1Q9NRX5 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SERINC1Q9NRX5 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SERINC1Q9NRX5 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SERINC1Q9NRX5 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SERINC1Q9NRX5 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SERINC1Q9NRX5 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SERINC1Q9NRX5 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SERINC1Q9NRX5 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SERINC1Q9NRX5 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SERINC1Q9NRX5 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SERINC1Q9NRX5 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SERINC1Q9NRX5 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SERINC1Q9NRX5 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SERINC1Q9NRX5 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SERINC1Q9NRX5 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SERINC1Q9NRX5 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SERINC1Q9NRX5 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SERINC1Q9NRX5 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SERINC1Q9NRX5 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SERINC1Q9NRX5 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SERINC1Q9NRX5 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SERINC1Q9NRX5 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SERINC1Q9NRX5 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SERINC1Q9NRX5 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SERINC1Q9NRX5 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SERINC1Q9NRX5 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SERINC1Q9NRX5 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SERINC1Q9NRX5 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SERINC1Q9NRX5 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SERINC1Q9NRX5 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SERINC1Q9NRX5 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SERINC1Q9NRX5 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SERINC1Q9NRX5 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SERINC1Q9NRX5 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SERINC1Q9NRX5 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SERINC1Q9NRX5 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SERINC1Q9NRX5 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SERINC1Q9NRX5 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SERINC1Q9NRX5 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms