Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LHX9Q9NQ69 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms