Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
FANCFQ9NPI8 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
FANCFQ9NPI8 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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