Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG1

FZD3, Frizzled-3, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD3Q9NPG1 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
FZD3Q9NPG1 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
FZD3Q9NPG1 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms