Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPE6

SPAG4, Sperm-associated antigen 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPAG4Q9NPE6 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPAG4Q9NPE6 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPAG4Q9NPE6 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPAG4Q9NPE6 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPAG4Q9NPE6 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPAG4Q9NPE6 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPAG4Q9NPE6 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPAG4Q9NPE6 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPAG4Q9NPE6 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPAG4Q9NPE6 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPAG4Q9NPE6 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPAG4Q9NPE6 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPAG4Q9NPE6 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPAG4Q9NPE6 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
SPAG4Q9NPE6 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPAG4Q9NPE6 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPAG4Q9NPE6 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPAG4Q9NPE6 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPAG4Q9NPE6 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPAG4Q9NPE6 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPAG4Q9NPE6 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPAG4Q9NPE6 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPAG4Q9NPE6 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPAG4Q9NPE6 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPAG4Q9NPE6 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPAG4Q9NPE6 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPAG4Q9NPE6 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPAG4Q9NPE6 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPAG4Q9NPE6 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPAG4Q9NPE6 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPAG4Q9NPE6 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPAG4Q9NPE6 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPAG4Q9NPE6 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPAG4Q9NPE6 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPAG4Q9NPE6 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
SPAG4Q9NPE6 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPAG4Q9NPE6 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPAG4Q9NPE6 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPAG4Q9NPE6 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPAG4Q9NPE6 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPAG4Q9NPE6 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SPAG4Q9NPE6 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPAG4Q9NPE6 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPAG4Q9NPE6 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPAG4Q9NPE6 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPAG4Q9NPE6 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPAG4Q9NPE6 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPAG4Q9NPE6 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPAG4Q9NPE6 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPAG4Q9NPE6 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPAG4Q9NPE6 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPAG4Q9NPE6 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPAG4Q9NPE6 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
SPAG4Q9NPE6 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPAG4Q9NPE6 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPAG4Q9NPE6 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPAG4Q9NPE6 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPAG4Q9NPE6 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPAG4Q9NPE6 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPAG4Q9NPE6 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPAG4Q9NPE6 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPAG4Q9NPE6 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPAG4Q9NPE6 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPAG4Q9NPE6 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPAG4Q9NPE6 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPAG4Q9NPE6 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPAG4Q9NPE6 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPAG4Q9NPE6 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPAG4Q9NPE6 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPAG4Q9NPE6 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPAG4Q9NPE6 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPAG4Q9NPE6 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPAG4Q9NPE6 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPAG4Q9NPE6 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPAG4Q9NPE6 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPAG4Q9NPE6 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
SPAG4Q9NPE6 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPAG4Q9NPE6 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPAG4Q9NPE6 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPAG4Q9NPE6 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPAG4Q9NPE6 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPAG4Q9NPE6 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPAG4Q9NPE6 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPAG4Q9NPE6 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
SPAG4Q9NPE6 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPAG4Q9NPE6 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPAG4Q9NPE6 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPAG4Q9NPE6 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPAG4Q9NPE6 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPAG4Q9NPE6 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPAG4Q9NPE6 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPAG4Q9NPE6 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPAG4Q9NPE6 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPAG4Q9NPE6 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPAG4Q9NPE6 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPAG4Q9NPE6 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPAG4Q9NPE6 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPAG4Q9NPE6 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPAG4Q9NPE6 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SPAG4Q9NPE6 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms