Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZU5

NYX, Nyctalopin, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NYXQ9GZU5 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NYXQ9GZU5 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NYXQ9GZU5 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NYXQ9GZU5 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NYXQ9GZU5 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NYXQ9GZU5 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NYXQ9GZU5 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NYXQ9GZU5 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NYXQ9GZU5 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NYXQ9GZU5 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NYXQ9GZU5 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NYXQ9GZU5 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NYXQ9GZU5 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NYXQ9GZU5 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NYXQ9GZU5 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NYXQ9GZU5 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NYXQ9GZU5 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NYXQ9GZU5 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NYXQ9GZU5 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NYXQ9GZU5 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NYXQ9GZU5 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NYXQ9GZU5 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NYXQ9GZU5 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NYXQ9GZU5 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NYXQ9GZU5 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NYXQ9GZU5 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NYXQ9GZU5 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NYXQ9GZU5 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NYXQ9GZU5 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NYXQ9GZU5 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
NYXQ9GZU5 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NYXQ9GZU5 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NYXQ9GZU5 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NYXQ9GZU5 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NYXQ9GZU5 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NYXQ9GZU5 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
NYXQ9GZU5 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NYXQ9GZU5 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NYXQ9GZU5 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NYXQ9GZU5 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NYXQ9GZU5 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NYXQ9GZU5 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NYXQ9GZU5 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
NYXQ9GZU5 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NYXQ9GZU5 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NYXQ9GZU5 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NYXQ9GZU5 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NYXQ9GZU5 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
NYXQ9GZU5 DBI-211ENST00000627093 554 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NYXQ9GZU5 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NYXQ9GZU5 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NYXQ9GZU5 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NYXQ9GZU5 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NYXQ9GZU5 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NYXQ9GZU5 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NYXQ9GZU5 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NYXQ9GZU5 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NYXQ9GZU5 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NYXQ9GZU5 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NYXQ9GZU5 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NYXQ9GZU5 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NYXQ9GZU5 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NYXQ9GZU5 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NYXQ9GZU5 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NYXQ9GZU5 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NYXQ9GZU5 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NYXQ9GZU5 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NYXQ9GZU5 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NYXQ9GZU5 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NYXQ9GZU5 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NYXQ9GZU5 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NYXQ9GZU5 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NYXQ9GZU5 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NYXQ9GZU5 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NYXQ9GZU5 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NYXQ9GZU5 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
NYXQ9GZU5 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NYXQ9GZU5 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NYXQ9GZU5 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NYXQ9GZU5 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NYXQ9GZU5 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NYXQ9GZU5 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NYXQ9GZU5 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NYXQ9GZU5 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NYXQ9GZU5 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NYXQ9GZU5 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NYXQ9GZU5 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NYXQ9GZU5 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NYXQ9GZU5 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NYXQ9GZU5 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NYXQ9GZU5 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
NYXQ9GZU5 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
NYXQ9GZU5 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
NYXQ9GZU5 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
NYXQ9GZU5 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
NYXQ9GZU5 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
NYXQ9GZU5 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NYXQ9GZU5 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NYXQ9GZU5 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
NYXQ9GZU5 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms