Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG8

GSDMC, Gasdermin-C, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMCQ9BYG8 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GSDMCQ9BYG8 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GSDMCQ9BYG8 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GSDMCQ9BYG8 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GSDMCQ9BYG8 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GSDMCQ9BYG8 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GSDMCQ9BYG8 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GSDMCQ9BYG8 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GSDMCQ9BYG8 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GSDMCQ9BYG8 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GSDMCQ9BYG8 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GSDMCQ9BYG8 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GSDMCQ9BYG8 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GSDMCQ9BYG8 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GSDMCQ9BYG8 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GSDMCQ9BYG8 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GSDMCQ9BYG8 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GSDMCQ9BYG8 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
GSDMCQ9BYG8 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GSDMCQ9BYG8 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GSDMCQ9BYG8 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GSDMCQ9BYG8 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
GSDMCQ9BYG8 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
GSDMCQ9BYG8 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GSDMCQ9BYG8 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GSDMCQ9BYG8 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GSDMCQ9BYG8 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GSDMCQ9BYG8 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GSDMCQ9BYG8 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GSDMCQ9BYG8 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GSDMCQ9BYG8 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GSDMCQ9BYG8 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GSDMCQ9BYG8 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GSDMCQ9BYG8 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GSDMCQ9BYG8 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GSDMCQ9BYG8 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GSDMCQ9BYG8 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GSDMCQ9BYG8 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GSDMCQ9BYG8 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GSDMCQ9BYG8 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GSDMCQ9BYG8 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GSDMCQ9BYG8 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GSDMCQ9BYG8 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GSDMCQ9BYG8 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GSDMCQ9BYG8 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GSDMCQ9BYG8 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GSDMCQ9BYG8 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GSDMCQ9BYG8 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GSDMCQ9BYG8 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GSDMCQ9BYG8 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GSDMCQ9BYG8 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GSDMCQ9BYG8 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GSDMCQ9BYG8 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
GSDMCQ9BYG8 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GSDMCQ9BYG8 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GSDMCQ9BYG8 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GSDMCQ9BYG8 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GSDMCQ9BYG8 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GSDMCQ9BYG8 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GSDMCQ9BYG8 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GSDMCQ9BYG8 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GSDMCQ9BYG8 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GSDMCQ9BYG8 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GSDMCQ9BYG8 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GSDMCQ9BYG8 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GSDMCQ9BYG8 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GSDMCQ9BYG8 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
GSDMCQ9BYG8 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
GSDMCQ9BYG8 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GSDMCQ9BYG8 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GSDMCQ9BYG8 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GSDMCQ9BYG8 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GSDMCQ9BYG8 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GSDMCQ9BYG8 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GSDMCQ9BYG8 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GSDMCQ9BYG8 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GSDMCQ9BYG8 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GSDMCQ9BYG8 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GSDMCQ9BYG8 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GSDMCQ9BYG8 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GSDMCQ9BYG8 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GSDMCQ9BYG8 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GSDMCQ9BYG8 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GSDMCQ9BYG8 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GSDMCQ9BYG8 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GSDMCQ9BYG8 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GSDMCQ9BYG8 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GSDMCQ9BYG8 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GSDMCQ9BYG8 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GSDMCQ9BYG8 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
GSDMCQ9BYG8 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GSDMCQ9BYG8 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GSDMCQ9BYG8 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GSDMCQ9BYG8 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GSDMCQ9BYG8 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
GSDMCQ9BYG8 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
GSDMCQ9BYG8 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
GSDMCQ9BYG8 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.9 ms