Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCAPERQ9BY12 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCAPERQ9BY12 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCAPERQ9BY12 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCAPERQ9BY12 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCAPERQ9BY12 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCAPERQ9BY12 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCAPERQ9BY12 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCAPERQ9BY12 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCAPERQ9BY12 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCAPERQ9BY12 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCAPERQ9BY12 AC118344.1-201ENST00000378432 1462 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCAPERQ9BY12 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SCAPERQ9BY12 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SCAPERQ9BY12 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SCAPERQ9BY12 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SCAPERQ9BY12 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SCAPERQ9BY12 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SCAPERQ9BY12 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SCAPERQ9BY12 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SCAPERQ9BY12 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SCAPERQ9BY12 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SCAPERQ9BY12 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SCAPERQ9BY12 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SCAPERQ9BY12 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SCAPERQ9BY12 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SCAPERQ9BY12 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SCAPERQ9BY12 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SCAPERQ9BY12 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SCAPERQ9BY12 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SCAPERQ9BY12 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SCAPERQ9BY12 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SCAPERQ9BY12 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SCAPERQ9BY12 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SCAPERQ9BY12 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SCAPERQ9BY12 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SCAPERQ9BY12 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SCAPERQ9BY12 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SCAPERQ9BY12 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SCAPERQ9BY12 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SCAPERQ9BY12 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SCAPERQ9BY12 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SCAPERQ9BY12 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SCAPERQ9BY12 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SCAPERQ9BY12 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SCAPERQ9BY12 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SCAPERQ9BY12 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SCAPERQ9BY12 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SCAPERQ9BY12 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SCAPERQ9BY12 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SCAPERQ9BY12 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SCAPERQ9BY12 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SCAPERQ9BY12 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SCAPERQ9BY12 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SCAPERQ9BY12 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SCAPERQ9BY12 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SCAPERQ9BY12 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SCAPERQ9BY12 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCAPERQ9BY12 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCAPERQ9BY12 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SCAPERQ9BY12 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCAPERQ9BY12 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCAPERQ9BY12 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCAPERQ9BY12 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCAPERQ9BY12 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCAPERQ9BY12 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCAPERQ9BY12 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCAPERQ9BY12 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCAPERQ9BY12 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCAPERQ9BY12 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCAPERQ9BY12 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCAPERQ9BY12 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SCAPERQ9BY12 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
SCAPERQ9BY12 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SCAPERQ9BY12 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SCAPERQ9BY12 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SCAPERQ9BY12 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SCAPERQ9BY12 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SCAPERQ9BY12 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SCAPERQ9BY12 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
SCAPERQ9BY12 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SCAPERQ9BY12 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SCAPERQ9BY12 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SCAPERQ9BY12 AC007388.1-210ENST00000415640 458 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
SCAPERQ9BY12 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SCAPERQ9BY12 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SCAPERQ9BY12 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SCAPERQ9BY12 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
SCAPERQ9BY12 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SCAPERQ9BY12 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
SCAPERQ9BY12 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SCAPERQ9BY12 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
SCAPERQ9BY12 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SCAPERQ9BY12 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
SCAPERQ9BY12 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
SCAPERQ9BY12 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
SCAPERQ9BY12 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SCAPERQ9BY12 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCAPERQ9BY12 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SCAPERQ9BY12 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms