Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQY4

RHOXF2, Rhox homeobox family member 2, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF2Q9BQY4 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
RHOXF2Q9BQY4 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms