Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ50

TREX2, Three prime repair exonuclease 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREX2Q9BQ50 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TREX2Q9BQ50 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TREX2Q9BQ50 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TREX2Q9BQ50 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TREX2Q9BQ50 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TREX2Q9BQ50 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TREX2Q9BQ50 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TREX2Q9BQ50 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TREX2Q9BQ50 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TREX2Q9BQ50 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TREX2Q9BQ50 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TREX2Q9BQ50 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TREX2Q9BQ50 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TREX2Q9BQ50 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TREX2Q9BQ50 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TREX2Q9BQ50 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TREX2Q9BQ50 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TREX2Q9BQ50 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TREX2Q9BQ50 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TREX2Q9BQ50 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TREX2Q9BQ50 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TREX2Q9BQ50 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TREX2Q9BQ50 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TREX2Q9BQ50 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TREX2Q9BQ50 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TREX2Q9BQ50 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TREX2Q9BQ50 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TREX2Q9BQ50 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TREX2Q9BQ50 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TREX2Q9BQ50 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TREX2Q9BQ50 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TREX2Q9BQ50 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TREX2Q9BQ50 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TREX2Q9BQ50 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TREX2Q9BQ50 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TREX2Q9BQ50 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TREX2Q9BQ50 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TREX2Q9BQ50 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TREX2Q9BQ50 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TREX2Q9BQ50 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TREX2Q9BQ50 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TREX2Q9BQ50 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TREX2Q9BQ50 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TREX2Q9BQ50 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TREX2Q9BQ50 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TREX2Q9BQ50 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TREX2Q9BQ50 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TREX2Q9BQ50 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TREX2Q9BQ50 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TREX2Q9BQ50 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TREX2Q9BQ50 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TREX2Q9BQ50 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TREX2Q9BQ50 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TREX2Q9BQ50 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TREX2Q9BQ50 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TREX2Q9BQ50 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TREX2Q9BQ50 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TREX2Q9BQ50 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TREX2Q9BQ50 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TREX2Q9BQ50 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TREX2Q9BQ50 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TREX2Q9BQ50 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TREX2Q9BQ50 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TREX2Q9BQ50 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TREX2Q9BQ50 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TREX2Q9BQ50 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TREX2Q9BQ50 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TREX2Q9BQ50 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TREX2Q9BQ50 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TREX2Q9BQ50 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TREX2Q9BQ50 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TREX2Q9BQ50 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TREX2Q9BQ50 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
TREX2Q9BQ50 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TREX2Q9BQ50 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TREX2Q9BQ50 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TREX2Q9BQ50 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TREX2Q9BQ50 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
TREX2Q9BQ50 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TREX2Q9BQ50 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
TREX2Q9BQ50 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TREX2Q9BQ50 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TREX2Q9BQ50 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TREX2Q9BQ50 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TREX2Q9BQ50 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TREX2Q9BQ50 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TREX2Q9BQ50 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TREX2Q9BQ50 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TREX2Q9BQ50 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TREX2Q9BQ50 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TREX2Q9BQ50 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TREX2Q9BQ50 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TREX2Q9BQ50 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TREX2Q9BQ50 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TREX2Q9BQ50 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TREX2Q9BQ50 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TREX2Q9BQ50 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TREX2Q9BQ50 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TREX2Q9BQ50 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TREX2Q9BQ50 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms