Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPW8

NIPSNAP1, Protein NipSnap homolog 1, humanhuman

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Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP1Q9BPW8 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 ARL8B-201ENST00000256496 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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NIPSNAP1Q9BPW8 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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NIPSNAP1Q9BPW8 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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NIPSNAP1Q9BPW8 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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NIPSNAP1Q9BPW8 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
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NIPSNAP1Q9BPW8 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NIPSNAP1Q9BPW8 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
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