Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 CD9-203ENST00000382518 1556 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
RBBP8Q99708 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms