Protein–RNA interactions for Protein: Q99684

GFI1, Zinc finger protein Gfi-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFI1Q99684 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GFI1Q99684 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GFI1Q99684 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GFI1Q99684 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GFI1Q99684 MED26-201ENST00000263390 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GFI1Q99684 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GFI1Q99684 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GFI1Q99684 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GFI1Q99684 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GFI1Q99684 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GFI1Q99684 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
GFI1Q99684 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GFI1Q99684 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GFI1Q99684 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GFI1Q99684 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GFI1Q99684 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GFI1Q99684 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
GFI1Q99684 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GFI1Q99684 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GFI1Q99684 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GFI1Q99684 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GFI1Q99684 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GFI1Q99684 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GFI1Q99684 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GFI1Q99684 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GFI1Q99684 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GFI1Q99684 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GFI1Q99684 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GFI1Q99684 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GFI1Q99684 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GFI1Q99684 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
GFI1Q99684 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
GFI1Q99684 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
GFI1Q99684 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GFI1Q99684 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GFI1Q99684 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GFI1Q99684 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GFI1Q99684 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GFI1Q99684 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GFI1Q99684 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GFI1Q99684 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GFI1Q99684 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GFI1Q99684 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GFI1Q99684 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GFI1Q99684 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GFI1Q99684 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GFI1Q99684 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GFI1Q99684 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GFI1Q99684 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GFI1Q99684 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GFI1Q99684 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GFI1Q99684 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GFI1Q99684 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GFI1Q99684 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GFI1Q99684 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GFI1Q99684 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GFI1Q99684 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GFI1Q99684 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GFI1Q99684 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
GFI1Q99684 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GFI1Q99684 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GFI1Q99684 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GFI1Q99684 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GFI1Q99684 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GFI1Q99684 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GFI1Q99684 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GFI1Q99684 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GFI1Q99684 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GFI1Q99684 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
GFI1Q99684 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GFI1Q99684 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GFI1Q99684 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GFI1Q99684 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GFI1Q99684 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GFI1Q99684 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
GFI1Q99684 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
GFI1Q99684 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
GFI1Q99684 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
GFI1Q99684 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
GFI1Q99684 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
GFI1Q99684 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
GFI1Q99684 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GFI1Q99684 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GFI1Q99684 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GFI1Q99684 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GFI1Q99684 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GFI1Q99684 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GFI1Q99684 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GFI1Q99684 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GFI1Q99684 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GFI1Q99684 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GFI1Q99684 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GFI1Q99684 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GFI1Q99684 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GFI1Q99684 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
GFI1Q99684 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GFI1Q99684 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
GFI1Q99684 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GFI1Q99684 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
GFI1Q99684 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54 ms