Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VAT1Q99536 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms