Protein–RNA interactions for Protein: Q96LW1

ZNF354B, Zinc finger protein 354B, humanhuman

Predictions only

Length 612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF354BQ96LW1 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF354BQ96LW1 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF354BQ96LW1 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF354BQ96LW1 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF354BQ96LW1 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
ZNF354BQ96LW1 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF354BQ96LW1 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF354BQ96LW1 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF354BQ96LW1 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF354BQ96LW1 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF354BQ96LW1 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF354BQ96LW1 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF354BQ96LW1 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF354BQ96LW1 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF354BQ96LW1 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF354BQ96LW1 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF354BQ96LW1 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF354BQ96LW1 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF354BQ96LW1 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF354BQ96LW1 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF354BQ96LW1 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF354BQ96LW1 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF354BQ96LW1 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF354BQ96LW1 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF354BQ96LW1 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF354BQ96LW1 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF354BQ96LW1 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF354BQ96LW1 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF354BQ96LW1 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF354BQ96LW1 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF354BQ96LW1 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF354BQ96LW1 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF354BQ96LW1 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF354BQ96LW1 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF354BQ96LW1 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF354BQ96LW1 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF354BQ96LW1 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF354BQ96LW1 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF354BQ96LW1 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF354BQ96LW1 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF354BQ96LW1 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF354BQ96LW1 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF354BQ96LW1 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF354BQ96LW1 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF354BQ96LW1 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF354BQ96LW1 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF354BQ96LW1 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF354BQ96LW1 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF354BQ96LW1 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF354BQ96LW1 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF354BQ96LW1 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF354BQ96LW1 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF354BQ96LW1 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF354BQ96LW1 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF354BQ96LW1 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF354BQ96LW1 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
ZNF354BQ96LW1 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF354BQ96LW1 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF354BQ96LW1 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF354BQ96LW1 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF354BQ96LW1 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF354BQ96LW1 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF354BQ96LW1 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF354BQ96LW1 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF354BQ96LW1 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF354BQ96LW1 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF354BQ96LW1 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF354BQ96LW1 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF354BQ96LW1 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF354BQ96LW1 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF354BQ96LW1 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF354BQ96LW1 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF354BQ96LW1 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF354BQ96LW1 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF354BQ96LW1 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF354BQ96LW1 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF354BQ96LW1 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF354BQ96LW1 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF354BQ96LW1 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF354BQ96LW1 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF354BQ96LW1 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF354BQ96LW1 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF354BQ96LW1 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF354BQ96LW1 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF354BQ96LW1 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF354BQ96LW1 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF354BQ96LW1 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF354BQ96LW1 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF354BQ96LW1 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF354BQ96LW1 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF354BQ96LW1 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF354BQ96LW1 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF354BQ96LW1 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF354BQ96LW1 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF354BQ96LW1 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF354BQ96LW1 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF354BQ96LW1 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF354BQ96LW1 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF354BQ96LW1 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
ZNF354BQ96LW1 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms