Protein–RNA interactions for Protein: Q96L91

EP400, E1A-binding protein p400, humanhuman

Predictions only

Length 3,159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EP400Q96L91 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EP400Q96L91 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
EP400Q96L91 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EP400Q96L91 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EP400Q96L91 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EP400Q96L91 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EP400Q96L91 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EP400Q96L91 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EP400Q96L91 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EP400Q96L91 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EP400Q96L91 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EP400Q96L91 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EP400Q96L91 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EP400Q96L91 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
EP400Q96L91 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
EP400Q96L91 BCRP7-201ENST00000511549 544 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
EP400Q96L91 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EP400Q96L91 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EP400Q96L91 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EP400Q96L91 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EP400Q96L91 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EP400Q96L91 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EP400Q96L91 SLC25A26-201ENST00000336733 1023 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EP400Q96L91 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EP400Q96L91 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EP400Q96L91 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EP400Q96L91 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EP400Q96L91 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EP400Q96L91 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EP400Q96L91 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EP400Q96L91 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EP400Q96L91 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EP400Q96L91 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EP400Q96L91 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EP400Q96L91 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EP400Q96L91 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EP400Q96L91 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EP400Q96L91 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EP400Q96L91 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EP400Q96L91 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EP400Q96L91 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EP400Q96L91 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EP400Q96L91 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EP400Q96L91 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EP400Q96L91 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EP400Q96L91 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EP400Q96L91 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EP400Q96L91 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EP400Q96L91 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EP400Q96L91 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EP400Q96L91 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EP400Q96L91 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EP400Q96L91 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EP400Q96L91 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EP400Q96L91 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EP400Q96L91 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EP400Q96L91 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EP400Q96L91 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EP400Q96L91 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EP400Q96L91 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EP400Q96L91 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EP400Q96L91 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EP400Q96L91 AL583722.2-201ENST00000557223 663 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EP400Q96L91 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
EP400Q96L91 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EP400Q96L91 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EP400Q96L91 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EP400Q96L91 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EP400Q96L91 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EP400Q96L91 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EP400Q96L91 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EP400Q96L91 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EP400Q96L91 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EP400Q96L91 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EP400Q96L91 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EP400Q96L91 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EP400Q96L91 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EP400Q96L91 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EP400Q96L91 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EP400Q96L91 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EP400Q96L91 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EP400Q96L91 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EP400Q96L91 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EP400Q96L91 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EP400Q96L91 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EP400Q96L91 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EP400Q96L91 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EP400Q96L91 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EP400Q96L91 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EP400Q96L91 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EP400Q96L91 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EP400Q96L91 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
EP400Q96L91 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EP400Q96L91 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
EP400Q96L91 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EP400Q96L91 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
EP400Q96L91 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EP400Q96L91 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EP400Q96L91 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EP400Q96L91 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
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