Protein–RNA interactions for Protein: Q92484

SMPDL3A, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3a, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPDL3AQ92484 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SMPDL3AQ92484 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMPDL3AQ92484 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMPDL3AQ92484 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMPDL3AQ92484 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMPDL3AQ92484 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMPDL3AQ92484 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMPDL3AQ92484 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMPDL3AQ92484 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMPDL3AQ92484 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMPDL3AQ92484 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMPDL3AQ92484 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMPDL3AQ92484 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SMPDL3AQ92484 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMPDL3AQ92484 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMPDL3AQ92484 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMPDL3AQ92484 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMPDL3AQ92484 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMPDL3AQ92484 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMPDL3AQ92484 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMPDL3AQ92484 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMPDL3AQ92484 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMPDL3AQ92484 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMPDL3AQ92484 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMPDL3AQ92484 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMPDL3AQ92484 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMPDL3AQ92484 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMPDL3AQ92484 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMPDL3AQ92484 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMPDL3AQ92484 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SMPDL3AQ92484 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMPDL3AQ92484 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SMPDL3AQ92484 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMPDL3AQ92484 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SMPDL3AQ92484 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SMPDL3AQ92484 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMPDL3AQ92484 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMPDL3AQ92484 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMPDL3AQ92484 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMPDL3AQ92484 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMPDL3AQ92484 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMPDL3AQ92484 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMPDL3AQ92484 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMPDL3AQ92484 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMPDL3AQ92484 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMPDL3AQ92484 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMPDL3AQ92484 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMPDL3AQ92484 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMPDL3AQ92484 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
SMPDL3AQ92484 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SMPDL3AQ92484 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SMPDL3AQ92484 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SMPDL3AQ92484 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SMPDL3AQ92484 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SMPDL3AQ92484 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SMPDL3AQ92484 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SMPDL3AQ92484 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SMPDL3AQ92484 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SMPDL3AQ92484 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMPDL3AQ92484 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMPDL3AQ92484 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMPDL3AQ92484 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMPDL3AQ92484 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMPDL3AQ92484 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMPDL3AQ92484 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMPDL3AQ92484 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMPDL3AQ92484 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMPDL3AQ92484 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SMPDL3AQ92484 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMPDL3AQ92484 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMPDL3AQ92484 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SMPDL3AQ92484 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SMPDL3AQ92484 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMPDL3AQ92484 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMPDL3AQ92484 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMPDL3AQ92484 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMPDL3AQ92484 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMPDL3AQ92484 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMPDL3AQ92484 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMPDL3AQ92484 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMPDL3AQ92484 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMPDL3AQ92484 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMPDL3AQ92484 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMPDL3AQ92484 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMPDL3AQ92484 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMPDL3AQ92484 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMPDL3AQ92484 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMPDL3AQ92484 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMPDL3AQ92484 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMPDL3AQ92484 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMPDL3AQ92484 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SMPDL3AQ92484 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMPDL3AQ92484 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMPDL3AQ92484 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMPDL3AQ92484 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMPDL3AQ92484 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMPDL3AQ92484 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMPDL3AQ92484 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMPDL3AQ92484 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
SMPDL3AQ92484 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms