Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ74

CTTNBP2, Cortactin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,663 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNBP2Q8WZ74 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CTTNBP2Q8WZ74 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CTTNBP2Q8WZ74 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CTTNBP2Q8WZ74 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CTTNBP2Q8WZ74 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
CTTNBP2Q8WZ74 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
CTTNBP2Q8WZ74 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CTTNBP2Q8WZ74 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
CTTNBP2Q8WZ74 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CTTNBP2Q8WZ74 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CTTNBP2Q8WZ74 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CTTNBP2Q8WZ74 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
CTTNBP2Q8WZ74 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CTTNBP2Q8WZ74 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CTTNBP2Q8WZ74 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CTTNBP2Q8WZ74 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CTTNBP2Q8WZ74 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CTTNBP2Q8WZ74 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CTTNBP2Q8WZ74 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CTTNBP2Q8WZ74 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CTTNBP2Q8WZ74 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CTTNBP2Q8WZ74 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CTTNBP2Q8WZ74 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CTTNBP2Q8WZ74 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CTTNBP2Q8WZ74 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CTTNBP2Q8WZ74 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CTTNBP2Q8WZ74 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CTTNBP2Q8WZ74 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CTTNBP2Q8WZ74 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CTTNBP2Q8WZ74 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CTTNBP2Q8WZ74 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CTTNBP2Q8WZ74 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
CTTNBP2Q8WZ74 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CTTNBP2Q8WZ74 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
CTTNBP2Q8WZ74 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
CTTNBP2Q8WZ74 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CTTNBP2Q8WZ74 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CTTNBP2Q8WZ74 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CTTNBP2Q8WZ74 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CTTNBP2Q8WZ74 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CTTNBP2Q8WZ74 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CTTNBP2Q8WZ74 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CTTNBP2Q8WZ74 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CTTNBP2Q8WZ74 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CTTNBP2Q8WZ74 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CTTNBP2Q8WZ74 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CTTNBP2Q8WZ74 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CTTNBP2Q8WZ74 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CTTNBP2Q8WZ74 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CTTNBP2Q8WZ74 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CTTNBP2Q8WZ74 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CTTNBP2Q8WZ74 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CTTNBP2Q8WZ74 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CTTNBP2Q8WZ74 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CTTNBP2Q8WZ74 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CTTNBP2Q8WZ74 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
CTTNBP2Q8WZ74 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CTTNBP2Q8WZ74 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CTTNBP2Q8WZ74 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CTTNBP2Q8WZ74 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CTTNBP2Q8WZ74 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CTTNBP2Q8WZ74 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CTTNBP2Q8WZ74 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CTTNBP2Q8WZ74 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CTTNBP2Q8WZ74 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CTTNBP2Q8WZ74 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CTTNBP2Q8WZ74 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CTTNBP2Q8WZ74 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CTTNBP2Q8WZ74 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CTTNBP2Q8WZ74 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CTTNBP2Q8WZ74 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CTTNBP2Q8WZ74 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CTTNBP2Q8WZ74 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CTTNBP2Q8WZ74 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
CTTNBP2Q8WZ74 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CTTNBP2Q8WZ74 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CTTNBP2Q8WZ74 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CTTNBP2Q8WZ74 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CTTNBP2Q8WZ74 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CTTNBP2Q8WZ74 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CTTNBP2Q8WZ74 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CTTNBP2Q8WZ74 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CTTNBP2Q8WZ74 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CTTNBP2Q8WZ74 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CTTNBP2Q8WZ74 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CTTNBP2Q8WZ74 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CTTNBP2Q8WZ74 CCKAR-201ENST00000295589 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CTTNBP2Q8WZ74 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CTTNBP2Q8WZ74 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CTTNBP2Q8WZ74 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CTTNBP2Q8WZ74 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CTTNBP2Q8WZ74 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CTTNBP2Q8WZ74 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CTTNBP2Q8WZ74 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CTTNBP2Q8WZ74 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CTTNBP2Q8WZ74 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CTTNBP2Q8WZ74 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CTTNBP2Q8WZ74 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CTTNBP2Q8WZ74 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CTTNBP2Q8WZ74 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms