Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV44

TRIM41, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM41, humanhuman

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM41Q8WV44 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TRIM41Q8WV44 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TRIM41Q8WV44 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TRIM41Q8WV44 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TRIM41Q8WV44 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TRIM41Q8WV44 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TRIM41Q8WV44 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TRIM41Q8WV44 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TRIM41Q8WV44 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TRIM41Q8WV44 NUDT1-206ENST00000397049 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TRIM41Q8WV44 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TRIM41Q8WV44 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TRIM41Q8WV44 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TRIM41Q8WV44 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TRIM41Q8WV44 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
TRIM41Q8WV44 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TRIM41Q8WV44 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TRIM41Q8WV44 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TRIM41Q8WV44 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TRIM41Q8WV44 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TRIM41Q8WV44 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TRIM41Q8WV44 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TRIM41Q8WV44 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TRIM41Q8WV44 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TRIM41Q8WV44 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TRIM41Q8WV44 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TRIM41Q8WV44 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TRIM41Q8WV44 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TRIM41Q8WV44 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TRIM41Q8WV44 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
TRIM41Q8WV44 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TRIM41Q8WV44 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TRIM41Q8WV44 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TRIM41Q8WV44 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
TRIM41Q8WV44 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
TRIM41Q8WV44 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
TRIM41Q8WV44 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TRIM41Q8WV44 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TRIM41Q8WV44 POU3F2-201ENST00000328345 4879 ntAPPRIS P1 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TRIM41Q8WV44 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TRIM41Q8WV44 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TRIM41Q8WV44 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TRIM41Q8WV44 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TRIM41Q8WV44 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TRIM41Q8WV44 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TRIM41Q8WV44 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TRIM41Q8WV44 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TRIM41Q8WV44 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TRIM41Q8WV44 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TRIM41Q8WV44 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TRIM41Q8WV44 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TRIM41Q8WV44 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TRIM41Q8WV44 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
TRIM41Q8WV44 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
TRIM41Q8WV44 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TRIM41Q8WV44 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TRIM41Q8WV44 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TRIM41Q8WV44 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TRIM41Q8WV44 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TRIM41Q8WV44 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TRIM41Q8WV44 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TRIM41Q8WV44 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
TRIM41Q8WV44 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.2
TRIM41Q8WV44 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TRIM41Q8WV44 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TRIM41Q8WV44 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TRIM41Q8WV44 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TRIM41Q8WV44 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TRIM41Q8WV44 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TRIM41Q8WV44 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TRIM41Q8WV44 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TRIM41Q8WV44 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TRIM41Q8WV44 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TRIM41Q8WV44 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TRIM41Q8WV44 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TRIM41Q8WV44 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
TRIM41Q8WV44 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TRIM41Q8WV44 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TRIM41Q8WV44 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TRIM41Q8WV44 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TRIM41Q8WV44 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TRIM41Q8WV44 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TRIM41Q8WV44 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TRIM41Q8WV44 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TRIM41Q8WV44 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
TRIM41Q8WV44 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TRIM41Q8WV44 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TRIM41Q8WV44 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TRIM41Q8WV44 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TRIM41Q8WV44 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TRIM41Q8WV44 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TRIM41Q8WV44 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TRIM41Q8WV44 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
TRIM41Q8WV44 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TRIM41Q8WV44 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
TRIM41Q8WV44 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TRIM41Q8WV44 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TRIM41Q8WV44 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TRIM41Q8WV44 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
TRIM41Q8WV44 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms