Protein–RNA interactions for Protein: Q8N398

VWA5B2, von Willebrand factor A domain-containing protein 5B2, humanhuman

Predictions only

Length 1,253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA5B2Q8N398 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VWA5B2Q8N398 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
VWA5B2Q8N398 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VWA5B2Q8N398 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VWA5B2Q8N398 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VWA5B2Q8N398 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VWA5B2Q8N398 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
VWA5B2Q8N398 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VWA5B2Q8N398 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VWA5B2Q8N398 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
VWA5B2Q8N398 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VWA5B2Q8N398 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VWA5B2Q8N398 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
VWA5B2Q8N398 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
VWA5B2Q8N398 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VWA5B2Q8N398 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VWA5B2Q8N398 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VWA5B2Q8N398 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VWA5B2Q8N398 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VWA5B2Q8N398 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VWA5B2Q8N398 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
VWA5B2Q8N398 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VWA5B2Q8N398 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VWA5B2Q8N398 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
VWA5B2Q8N398 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VWA5B2Q8N398 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
VWA5B2Q8N398 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VWA5B2Q8N398 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VWA5B2Q8N398 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VWA5B2Q8N398 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VWA5B2Q8N398 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VWA5B2Q8N398 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VWA5B2Q8N398 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VWA5B2Q8N398 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VWA5B2Q8N398 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VWA5B2Q8N398 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VWA5B2Q8N398 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
VWA5B2Q8N398 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VWA5B2Q8N398 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
VWA5B2Q8N398 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VWA5B2Q8N398 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VWA5B2Q8N398 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VWA5B2Q8N398 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VWA5B2Q8N398 AC012183.1-201ENST00000625197 499 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
VWA5B2Q8N398 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VWA5B2Q8N398 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VWA5B2Q8N398 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VWA5B2Q8N398 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VWA5B2Q8N398 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VWA5B2Q8N398 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VWA5B2Q8N398 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VWA5B2Q8N398 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VWA5B2Q8N398 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VWA5B2Q8N398 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VWA5B2Q8N398 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
VWA5B2Q8N398 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
VWA5B2Q8N398 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VWA5B2Q8N398 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VWA5B2Q8N398 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VWA5B2Q8N398 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VWA5B2Q8N398 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VWA5B2Q8N398 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VWA5B2Q8N398 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VWA5B2Q8N398 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VWA5B2Q8N398 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VWA5B2Q8N398 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VWA5B2Q8N398 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VWA5B2Q8N398 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
VWA5B2Q8N398 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VWA5B2Q8N398 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VWA5B2Q8N398 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VWA5B2Q8N398 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VWA5B2Q8N398 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VWA5B2Q8N398 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
VWA5B2Q8N398 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
VWA5B2Q8N398 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
VWA5B2Q8N398 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
VWA5B2Q8N398 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VWA5B2Q8N398 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VWA5B2Q8N398 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VWA5B2Q8N398 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VWA5B2Q8N398 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VWA5B2Q8N398 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VWA5B2Q8N398 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VWA5B2Q8N398 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VWA5B2Q8N398 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VWA5B2Q8N398 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VWA5B2Q8N398 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VWA5B2Q8N398 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VWA5B2Q8N398 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VWA5B2Q8N398 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
VWA5B2Q8N398 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VWA5B2Q8N398 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
VWA5B2Q8N398 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VWA5B2Q8N398 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VWA5B2Q8N398 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VWA5B2Q8N398 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
VWA5B2Q8N398 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VWA5B2Q8N398 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
VWA5B2Q8N398 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms