Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXQ3

C9orf40, Uncharacterized protein C9orf40, humanhuman

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf40Q8IXQ3 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf40Q8IXQ3 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf40Q8IXQ3 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf40Q8IXQ3 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf40Q8IXQ3 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf40Q8IXQ3 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf40Q8IXQ3 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf40Q8IXQ3 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf40Q8IXQ3 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf40Q8IXQ3 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf40Q8IXQ3 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf40Q8IXQ3 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf40Q8IXQ3 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
C9orf40Q8IXQ3 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf40Q8IXQ3 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf40Q8IXQ3 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf40Q8IXQ3 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf40Q8IXQ3 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf40Q8IXQ3 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf40Q8IXQ3 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf40Q8IXQ3 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf40Q8IXQ3 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf40Q8IXQ3 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf40Q8IXQ3 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf40Q8IXQ3 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf40Q8IXQ3 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf40Q8IXQ3 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf40Q8IXQ3 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf40Q8IXQ3 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf40Q8IXQ3 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf40Q8IXQ3 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf40Q8IXQ3 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf40Q8IXQ3 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf40Q8IXQ3 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf40Q8IXQ3 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf40Q8IXQ3 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf40Q8IXQ3 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf40Q8IXQ3 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf40Q8IXQ3 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf40Q8IXQ3 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf40Q8IXQ3 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf40Q8IXQ3 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf40Q8IXQ3 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf40Q8IXQ3 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf40Q8IXQ3 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf40Q8IXQ3 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf40Q8IXQ3 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf40Q8IXQ3 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf40Q8IXQ3 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf40Q8IXQ3 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf40Q8IXQ3 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf40Q8IXQ3 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf40Q8IXQ3 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf40Q8IXQ3 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf40Q8IXQ3 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf40Q8IXQ3 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf40Q8IXQ3 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf40Q8IXQ3 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
C9orf40Q8IXQ3 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf40Q8IXQ3 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf40Q8IXQ3 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf40Q8IXQ3 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf40Q8IXQ3 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf40Q8IXQ3 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf40Q8IXQ3 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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C9orf40Q8IXQ3 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf40Q8IXQ3 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf40Q8IXQ3 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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C9orf40Q8IXQ3 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
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C9orf40Q8IXQ3 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf40Q8IXQ3 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf40Q8IXQ3 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf40Q8IXQ3 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf40Q8IXQ3 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf40Q8IXQ3 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf40Q8IXQ3 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf40Q8IXQ3 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf40Q8IXQ3 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf40Q8IXQ3 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf40Q8IXQ3 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf40Q8IXQ3 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf40Q8IXQ3 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf40Q8IXQ3 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf40Q8IXQ3 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf40Q8IXQ3 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf40Q8IXQ3 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf40Q8IXQ3 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf40Q8IXQ3 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf40Q8IXQ3 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf40Q8IXQ3 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf40Q8IXQ3 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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