Protein–RNA interactions for Protein: Q86U86

PBRM1, Protein polybromo-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBRM1Q86U86 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
PBRM1Q86U86 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PBRM1Q86U86 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PBRM1Q86U86 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
PBRM1Q86U86 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PBRM1Q86U86 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PBRM1Q86U86 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
PBRM1Q86U86 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.92
PBRM1Q86U86 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.92
PBRM1Q86U86 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC27.08■■□□□ 1.92
PBRM1Q86U86 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC27.08■■□□□ 1.92
PBRM1Q86U86 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.92
PBRM1Q86U86 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PBRM1Q86U86 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PBRM1Q86U86 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PBRM1Q86U86 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PBRM1Q86U86 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PBRM1Q86U86 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PBRM1Q86U86 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PBRM1Q86U86 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PBRM1Q86U86 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PBRM1Q86U86 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PBRM1Q86U86 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
PBRM1Q86U86 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PBRM1Q86U86 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PBRM1Q86U86 AC099795.1-202ENST00000640492 759 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PBRM1Q86U86 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PBRM1Q86U86 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PBRM1Q86U86 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PBRM1Q86U86 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PBRM1Q86U86 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PBRM1Q86U86 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PBRM1Q86U86 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PBRM1Q86U86 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PBRM1Q86U86 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PBRM1Q86U86 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PBRM1Q86U86 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PBRM1Q86U86 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PBRM1Q86U86 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PBRM1Q86U86 IGLV2-23-201ENST00000390306 502 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PBRM1Q86U86 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PBRM1Q86U86 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PBRM1Q86U86 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PBRM1Q86U86 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PBRM1Q86U86 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
PBRM1Q86U86 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PBRM1Q86U86 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PBRM1Q86U86 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PBRM1Q86U86 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PBRM1Q86U86 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PBRM1Q86U86 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PBRM1Q86U86 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PBRM1Q86U86 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PBRM1Q86U86 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
PBRM1Q86U86 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
PBRM1Q86U86 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PBRM1Q86U86 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PBRM1Q86U86 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PBRM1Q86U86 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PBRM1Q86U86 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PBRM1Q86U86 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PBRM1Q86U86 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PBRM1Q86U86 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PBRM1Q86U86 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PBRM1Q86U86 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PBRM1Q86U86 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PBRM1Q86U86 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PBRM1Q86U86 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PBRM1Q86U86 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PBRM1Q86U86 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PBRM1Q86U86 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
PBRM1Q86U86 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PBRM1Q86U86 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PBRM1Q86U86 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PBRM1Q86U86 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PBRM1Q86U86 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PBRM1Q86U86 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PBRM1Q86U86 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PBRM1Q86U86 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PBRM1Q86U86 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PBRM1Q86U86 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PBRM1Q86U86 OSGIN2-203ENST00000520659 801 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PBRM1Q86U86 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PBRM1Q86U86 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PBRM1Q86U86 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PBRM1Q86U86 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PBRM1Q86U86 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PBRM1Q86U86 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
PBRM1Q86U86 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
PBRM1Q86U86 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PBRM1Q86U86 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PBRM1Q86U86 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PBRM1Q86U86 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PBRM1Q86U86 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PBRM1Q86U86 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
PBRM1Q86U86 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PBRM1Q86U86 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PBRM1Q86U86 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
PBRM1Q86U86 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PBRM1Q86U86 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms