Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5D8

NANOGNB, NANOG neighbor homeobox, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGNBQ7Z5D8 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NANOGNBQ7Z5D8 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NANOGNBQ7Z5D8 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NANOGNBQ7Z5D8 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NANOGNBQ7Z5D8 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NANOGNBQ7Z5D8 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NANOGNBQ7Z5D8 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NANOGNBQ7Z5D8 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NANOGNBQ7Z5D8 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NANOGNBQ7Z5D8 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NANOGNBQ7Z5D8 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NANOGNBQ7Z5D8 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NANOGNBQ7Z5D8 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NANOGNBQ7Z5D8 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NANOGNBQ7Z5D8 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NANOGNBQ7Z5D8 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NANOGNBQ7Z5D8 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NANOGNBQ7Z5D8 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NANOGNBQ7Z5D8 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
NANOGNBQ7Z5D8 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NANOGNBQ7Z5D8 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NANOGNBQ7Z5D8 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NANOGNBQ7Z5D8 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NANOGNBQ7Z5D8 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NANOGNBQ7Z5D8 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NANOGNBQ7Z5D8 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NANOGNBQ7Z5D8 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NANOGNBQ7Z5D8 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NANOGNBQ7Z5D8 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NANOGNBQ7Z5D8 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NANOGNBQ7Z5D8 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NANOGNBQ7Z5D8 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NANOGNBQ7Z5D8 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NANOGNBQ7Z5D8 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NANOGNBQ7Z5D8 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NANOGNBQ7Z5D8 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NANOGNBQ7Z5D8 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NANOGNBQ7Z5D8 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NANOGNBQ7Z5D8 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NANOGNBQ7Z5D8 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
NANOGNBQ7Z5D8 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NANOGNBQ7Z5D8 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
NANOGNBQ7Z5D8 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NANOGNBQ7Z5D8 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NANOGNBQ7Z5D8 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NANOGNBQ7Z5D8 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NANOGNBQ7Z5D8 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NANOGNBQ7Z5D8 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NANOGNBQ7Z5D8 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NANOGNBQ7Z5D8 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NANOGNBQ7Z5D8 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NANOGNBQ7Z5D8 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NANOGNBQ7Z5D8 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NANOGNBQ7Z5D8 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NANOGNBQ7Z5D8 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NANOGNBQ7Z5D8 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NANOGNBQ7Z5D8 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NANOGNBQ7Z5D8 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NANOGNBQ7Z5D8 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NANOGNBQ7Z5D8 AC010931.2-202ENST00000514871 2566 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NANOGNBQ7Z5D8 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NANOGNBQ7Z5D8 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NANOGNBQ7Z5D8 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NANOGNBQ7Z5D8 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NANOGNBQ7Z5D8 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NANOGNBQ7Z5D8 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NANOGNBQ7Z5D8 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NANOGNBQ7Z5D8 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NANOGNBQ7Z5D8 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NANOGNBQ7Z5D8 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
NANOGNBQ7Z5D8 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NANOGNBQ7Z5D8 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NANOGNBQ7Z5D8 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NANOGNBQ7Z5D8 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NANOGNBQ7Z5D8 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NANOGNBQ7Z5D8 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NANOGNBQ7Z5D8 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NANOGNBQ7Z5D8 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NANOGNBQ7Z5D8 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
NANOGNBQ7Z5D8 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NANOGNBQ7Z5D8 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NANOGNBQ7Z5D8 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NANOGNBQ7Z5D8 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NANOGNBQ7Z5D8 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
NANOGNBQ7Z5D8 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NANOGNBQ7Z5D8 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NANOGNBQ7Z5D8 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NANOGNBQ7Z5D8 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NANOGNBQ7Z5D8 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NANOGNBQ7Z5D8 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NANOGNBQ7Z5D8 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NANOGNBQ7Z5D8 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NANOGNBQ7Z5D8 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NANOGNBQ7Z5D8 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NANOGNBQ7Z5D8 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NANOGNBQ7Z5D8 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NANOGNBQ7Z5D8 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
NANOGNBQ7Z5D8 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
NANOGNBQ7Z5D8 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
NANOGNBQ7Z5D8 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.9 ms