Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z4N2

TRPM1, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPM1Q7Z4N2 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TRPM1Q7Z4N2 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TRPM1Q7Z4N2 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TRPM1Q7Z4N2 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRPM1Q7Z4N2 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRPM1Q7Z4N2 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRPM1Q7Z4N2 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRPM1Q7Z4N2 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRPM1Q7Z4N2 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRPM1Q7Z4N2 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TRPM1Q7Z4N2 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TRPM1Q7Z4N2 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRPM1Q7Z4N2 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRPM1Q7Z4N2 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TRPM1Q7Z4N2 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRPM1Q7Z4N2 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRPM1Q7Z4N2 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRPM1Q7Z4N2 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRPM1Q7Z4N2 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRPM1Q7Z4N2 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRPM1Q7Z4N2 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRPM1Q7Z4N2 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRPM1Q7Z4N2 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRPM1Q7Z4N2 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRPM1Q7Z4N2 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRPM1Q7Z4N2 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRPM1Q7Z4N2 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRPM1Q7Z4N2 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRPM1Q7Z4N2 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRPM1Q7Z4N2 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TRPM1Q7Z4N2 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRPM1Q7Z4N2 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRPM1Q7Z4N2 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRPM1Q7Z4N2 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRPM1Q7Z4N2 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRPM1Q7Z4N2 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TRPM1Q7Z4N2 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRPM1Q7Z4N2 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRPM1Q7Z4N2 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRPM1Q7Z4N2 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRPM1Q7Z4N2 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRPM1Q7Z4N2 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRPM1Q7Z4N2 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRPM1Q7Z4N2 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRPM1Q7Z4N2 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRPM1Q7Z4N2 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRPM1Q7Z4N2 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRPM1Q7Z4N2 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRPM1Q7Z4N2 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRPM1Q7Z4N2 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRPM1Q7Z4N2 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRPM1Q7Z4N2 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRPM1Q7Z4N2 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRPM1Q7Z4N2 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRPM1Q7Z4N2 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRPM1Q7Z4N2 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TRPM1Q7Z4N2 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRPM1Q7Z4N2 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRPM1Q7Z4N2 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TRPM1Q7Z4N2 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRPM1Q7Z4N2 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRPM1Q7Z4N2 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRPM1Q7Z4N2 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRPM1Q7Z4N2 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRPM1Q7Z4N2 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRPM1Q7Z4N2 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRPM1Q7Z4N2 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRPM1Q7Z4N2 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRPM1Q7Z4N2 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRPM1Q7Z4N2 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TRPM1Q7Z4N2 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRPM1Q7Z4N2 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRPM1Q7Z4N2 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRPM1Q7Z4N2 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TRPM1Q7Z4N2 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRPM1Q7Z4N2 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRPM1Q7Z4N2 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRPM1Q7Z4N2 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRPM1Q7Z4N2 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRPM1Q7Z4N2 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRPM1Q7Z4N2 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TRPM1Q7Z4N2 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRPM1Q7Z4N2 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRPM1Q7Z4N2 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRPM1Q7Z4N2 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRPM1Q7Z4N2 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRPM1Q7Z4N2 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRPM1Q7Z4N2 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRPM1Q7Z4N2 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRPM1Q7Z4N2 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRPM1Q7Z4N2 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRPM1Q7Z4N2 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRPM1Q7Z4N2 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRPM1Q7Z4N2 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRPM1Q7Z4N2 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRPM1Q7Z4N2 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRPM1Q7Z4N2 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRPM1Q7Z4N2 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRPM1Q7Z4N2 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TRPM1Q7Z4N2 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms