Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z398

ZNF550, Zinc finger protein 550, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF550Q7Z398 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
ZNF550Q7Z398 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms