Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ2

USP34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, humanhuman

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Length 3,546 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP34Q70CQ2 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP34Q70CQ2 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP34Q70CQ2 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP34Q70CQ2 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP34Q70CQ2 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP34Q70CQ2 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP34Q70CQ2 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP34Q70CQ2 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP34Q70CQ2 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP34Q70CQ2 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP34Q70CQ2 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
USP34Q70CQ2 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 CCDC88B-201ENST00000301897 870 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 AL121944.1-201ENST00000605945 686 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 YIF1A-210ENST00000496746 667 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 FKBPL-201ENST00000375156 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
USP34Q70CQ2 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
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