Protein–RNA interactions for Protein: Q5VSD8

Putative uncharacterized protein LOC401522, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q5VSD8 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Q5VSD8 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Q5VSD8 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Q5VSD8 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Q5VSD8 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Q5VSD8 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Q5VSD8 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Q5VSD8 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Q5VSD8 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Q5VSD8 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Q5VSD8 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Q5VSD8 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Q5VSD8 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Q5VSD8 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Q5VSD8 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Q5VSD8 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC10.27□□□□□ -0.77
Q5VSD8 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Q5VSD8 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Q5VSD8 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.27□□□□□ -0.77
Q5VSD8 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Q5VSD8 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q5VSD8 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q5VSD8 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q5VSD8 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q5VSD8 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q5VSD8 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q5VSD8 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q5VSD8 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q5VSD8 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q5VSD8 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q5VSD8 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q5VSD8 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q5VSD8 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q5VSD8 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q5VSD8 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q5VSD8 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q5VSD8 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q5VSD8 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q5VSD8 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q5VSD8 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q5VSD8 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q5VSD8 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q5VSD8 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q5VSD8 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q5VSD8 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q5VSD8 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q5VSD8 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q5VSD8 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q5VSD8 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q5VSD8 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q5VSD8 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q5VSD8 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q5VSD8 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Q5VSD8 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q5VSD8 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q5VSD8 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Q5VSD8 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q5VSD8 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Q5VSD8 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q5VSD8 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q5VSD8 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Q5VSD8 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q5VSD8 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q5VSD8 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q5VSD8 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q5VSD8 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q5VSD8 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Q5VSD8 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q5VSD8 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q5VSD8 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q5VSD8 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q5VSD8 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q5VSD8 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q5VSD8 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q5VSD8 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q5VSD8 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q5VSD8 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q5VSD8 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q5VSD8 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q5VSD8 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q5VSD8 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q5VSD8 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q5VSD8 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q5VSD8 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q5VSD8 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q5VSD8 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q5VSD8 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Q5VSD8 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q5VSD8 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q5VSD8 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q5VSD8 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q5VSD8 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q5VSD8 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q5VSD8 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q5VSD8 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q5VSD8 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q5VSD8 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q5VSD8 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q5VSD8 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Q5VSD8 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms