Protein–RNA interactions for Protein: Q5H8C1

FREM1, FRAS1-related extracellular matrix protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FREM1Q5H8C1 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FREM1Q5H8C1 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
FREM1Q5H8C1 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FREM1Q5H8C1 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FREM1Q5H8C1 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FREM1Q5H8C1 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FREM1Q5H8C1 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FREM1Q5H8C1 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FREM1Q5H8C1 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FREM1Q5H8C1 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
FREM1Q5H8C1 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
FREM1Q5H8C1 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FREM1Q5H8C1 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FREM1Q5H8C1 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FREM1Q5H8C1 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FREM1Q5H8C1 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FREM1Q5H8C1 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FREM1Q5H8C1 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FREM1Q5H8C1 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FREM1Q5H8C1 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FREM1Q5H8C1 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FREM1Q5H8C1 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FREM1Q5H8C1 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FREM1Q5H8C1 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FREM1Q5H8C1 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FREM1Q5H8C1 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FREM1Q5H8C1 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FREM1Q5H8C1 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FREM1Q5H8C1 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FREM1Q5H8C1 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FREM1Q5H8C1 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FREM1Q5H8C1 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FREM1Q5H8C1 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FREM1Q5H8C1 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FREM1Q5H8C1 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FREM1Q5H8C1 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FREM1Q5H8C1 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FREM1Q5H8C1 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FREM1Q5H8C1 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FREM1Q5H8C1 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FREM1Q5H8C1 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FREM1Q5H8C1 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FREM1Q5H8C1 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FREM1Q5H8C1 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
FREM1Q5H8C1 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FREM1Q5H8C1 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FREM1Q5H8C1 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FREM1Q5H8C1 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
FREM1Q5H8C1 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
FREM1Q5H8C1 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
FREM1Q5H8C1 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FREM1Q5H8C1 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
FREM1Q5H8C1 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FREM1Q5H8C1 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FREM1Q5H8C1 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FREM1Q5H8C1 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FREM1Q5H8C1 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FREM1Q5H8C1 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FREM1Q5H8C1 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FREM1Q5H8C1 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FREM1Q5H8C1 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FREM1Q5H8C1 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FREM1Q5H8C1 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FREM1Q5H8C1 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FREM1Q5H8C1 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FREM1Q5H8C1 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FREM1Q5H8C1 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FREM1Q5H8C1 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FREM1Q5H8C1 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FREM1Q5H8C1 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
FREM1Q5H8C1 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FREM1Q5H8C1 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FREM1Q5H8C1 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FREM1Q5H8C1 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FREM1Q5H8C1 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FREM1Q5H8C1 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FREM1Q5H8C1 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FREM1Q5H8C1 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FREM1Q5H8C1 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
FREM1Q5H8C1 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FREM1Q5H8C1 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
FREM1Q5H8C1 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FREM1Q5H8C1 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FREM1Q5H8C1 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FREM1Q5H8C1 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FREM1Q5H8C1 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FREM1Q5H8C1 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FREM1Q5H8C1 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FREM1Q5H8C1 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FREM1Q5H8C1 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FREM1Q5H8C1 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FREM1Q5H8C1 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FREM1Q5H8C1 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
FREM1Q5H8C1 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FREM1Q5H8C1 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
FREM1Q5H8C1 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
FREM1Q5H8C1 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FREM1Q5H8C1 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
FREM1Q5H8C1 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
FREM1Q5H8C1 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms