Protein–RNA interactions for Protein: Q2TAC2

CCDC57, Coiled-coil domain-containing protein 57, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC57Q2TAC2 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC57Q2TAC2 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC57Q2TAC2 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC57Q2TAC2 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC57Q2TAC2 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC57Q2TAC2 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC57Q2TAC2 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC57Q2TAC2 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC57Q2TAC2 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC57Q2TAC2 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC57Q2TAC2 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC57Q2TAC2 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC57Q2TAC2 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC57Q2TAC2 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC57Q2TAC2 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC57Q2TAC2 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC57Q2TAC2 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC57Q2TAC2 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC57Q2TAC2 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC57Q2TAC2 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC57Q2TAC2 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC57Q2TAC2 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC57Q2TAC2 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC57Q2TAC2 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC57Q2TAC2 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC57Q2TAC2 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC57Q2TAC2 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC57Q2TAC2 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC57Q2TAC2 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC57Q2TAC2 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC57Q2TAC2 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC57Q2TAC2 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC57Q2TAC2 RFPL4AP1-201ENST00000530883 850 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC57Q2TAC2 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC57Q2TAC2 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC57Q2TAC2 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC57Q2TAC2 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC57Q2TAC2 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC57Q2TAC2 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC57Q2TAC2 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC57Q2TAC2 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC57Q2TAC2 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC57Q2TAC2 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC57Q2TAC2 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
CCDC57Q2TAC2 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC57Q2TAC2 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC57Q2TAC2 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC57Q2TAC2 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC57Q2TAC2 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC57Q2TAC2 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC57Q2TAC2 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC57Q2TAC2 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC57Q2TAC2 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC57Q2TAC2 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC57Q2TAC2 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC57Q2TAC2 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC57Q2TAC2 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC57Q2TAC2 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC57Q2TAC2 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC57Q2TAC2 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC57Q2TAC2 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC57Q2TAC2 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC57Q2TAC2 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC57Q2TAC2 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC57Q2TAC2 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC57Q2TAC2 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC57Q2TAC2 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC57Q2TAC2 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC57Q2TAC2 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC57Q2TAC2 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC57Q2TAC2 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC57Q2TAC2 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC57Q2TAC2 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC57Q2TAC2 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC57Q2TAC2 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC57Q2TAC2 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC57Q2TAC2 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC57Q2TAC2 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC57Q2TAC2 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC57Q2TAC2 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC57Q2TAC2 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC57Q2TAC2 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC57Q2TAC2 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
CCDC57Q2TAC2 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC57Q2TAC2 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC57Q2TAC2 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC57Q2TAC2 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC57Q2TAC2 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC57Q2TAC2 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC57Q2TAC2 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC57Q2TAC2 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC57Q2TAC2 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC57Q2TAC2 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC57Q2TAC2 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC57Q2TAC2 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC57Q2TAC2 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC57Q2TAC2 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC57Q2TAC2 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC57Q2TAC2 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
CCDC57Q2TAC2 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms