Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC142Q17RM4 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC142Q17RM4 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC142Q17RM4 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC142Q17RM4 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC142Q17RM4 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC142Q17RM4 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC142Q17RM4 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC142Q17RM4 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC142Q17RM4 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC142Q17RM4 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC142Q17RM4 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC142Q17RM4 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC142Q17RM4 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC142Q17RM4 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC142Q17RM4 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC142Q17RM4 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC142Q17RM4 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CCDC142Q17RM4 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CCDC142Q17RM4 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
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