Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LAMA3Q16787 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
LAMA3Q16787 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LAMA3Q16787 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LAMA3Q16787 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
LAMA3Q16787 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LAMA3Q16787 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LAMA3Q16787 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LAMA3Q16787 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LAMA3Q16787 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
LAMA3Q16787 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LAMA3Q16787 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LAMA3Q16787 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
LAMA3Q16787 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
LAMA3Q16787 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
LAMA3Q16787 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
LAMA3Q16787 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LAMA3Q16787 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LAMA3Q16787 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LAMA3Q16787 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LAMA3Q16787 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LAMA3Q16787 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LAMA3Q16787 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
LAMA3Q16787 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LAMA3Q16787 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LAMA3Q16787 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LAMA3Q16787 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
LAMA3Q16787 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LAMA3Q16787 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LAMA3Q16787 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LAMA3Q16787 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LAMA3Q16787 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LAMA3Q16787 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LAMA3Q16787 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LAMA3Q16787 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LAMA3Q16787 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LAMA3Q16787 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LAMA3Q16787 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LAMA3Q16787 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LAMA3Q16787 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
LAMA3Q16787 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
LAMA3Q16787 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LAMA3Q16787 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LAMA3Q16787 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LAMA3Q16787 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LAMA3Q16787 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LAMA3Q16787 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LAMA3Q16787 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LAMA3Q16787 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LAMA3Q16787 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LAMA3Q16787 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
LAMA3Q16787 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LAMA3Q16787 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LAMA3Q16787 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LAMA3Q16787 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LAMA3Q16787 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LAMA3Q16787 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LAMA3Q16787 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
LAMA3Q16787 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
LAMA3Q16787 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
LAMA3Q16787 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LAMA3Q16787 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LAMA3Q16787 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LAMA3Q16787 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LAMA3Q16787 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LAMA3Q16787 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LAMA3Q16787 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LAMA3Q16787 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LAMA3Q16787 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LAMA3Q16787 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LAMA3Q16787 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LAMA3Q16787 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
LAMA3Q16787 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC18■□□□□ 0.47
LAMA3Q16787 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LAMA3Q16787 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LAMA3Q16787 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LAMA3Q16787 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LAMA3Q16787 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LAMA3Q16787 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LAMA3Q16787 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LAMA3Q16787 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LAMA3Q16787 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LAMA3Q16787 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LAMA3Q16787 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LAMA3Q16787 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
LAMA3Q16787 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC18■□□□□ 0.47
LAMA3Q16787 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LAMA3Q16787 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
LAMA3Q16787 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
LAMA3Q16787 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC18■□□□□ 0.47
LAMA3Q16787 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LAMA3Q16787 RPS24-214ENST00000613865 538 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LAMA3Q16787 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LAMA3Q16787 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LAMA3Q16787 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
LAMA3Q16787 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
LAMA3Q16787 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LAMA3Q16787 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LAMA3Q16787 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC18■□□□□ 0.47
LAMA3Q16787 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
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