Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CLPPQ16740 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CLPPQ16740 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
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